More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2916 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
284 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  44.98 
 
 
296 aa  231  7.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  33.22 
 
 
287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 
350 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  32.99 
 
 
279 aa  125  7e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 
295 aa  122  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  34.33 
 
 
308 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 
291 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 
298 aa  116  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  32.52 
 
 
290 aa  116  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  32.38 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.8 
 
 
368 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 
309 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
361 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.77 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.43 
 
 
368 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 
350 aa  113  3e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  30.97 
 
 
285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  32.16 
 
 
315 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.95 
 
 
369 aa  108  9.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  30.86 
 
 
309 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.99 
 
 
370 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  30.03 
 
 
286 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.36 
 
 
370 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
314 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  29.48 
 
 
257 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 
299 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 
267 aa  105  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.62 
 
 
370 aa  105  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  31.87 
 
 
301 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.81 
 
 
370 aa  104  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
340 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
340 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
340 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
340 aa  104  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.66 
 
 
285 aa  103  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.31 
 
 
286 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 
284 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
302 aa  102  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 
302 aa  101  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  26.98 
 
 
341 aa  101  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 
310 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
283 aa  100  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.36 
 
 
370 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 
283 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.64 
 
 
370 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2276  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 
305 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5402  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 
234 aa  99  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734063  normal  0.0675186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.56 
 
 
372 aa  99  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
301 aa  99  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
280 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  29.51 
 
 
299 aa  97.4  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.21 
 
 
372 aa  96.3  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.74 
 
 
367 aa  95.9  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.76 
 
 
371 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.76 
 
 
371 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.76 
 
 
371 aa  95.9  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  26.44 
 
 
306 aa  95.5  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2485  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 
353 aa  95.5  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.125677 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.42 
 
 
262 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
287 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.64 
 
 
370 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  27.51 
 
 
254 aa  94.4  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.55 
 
 
371 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 
284 aa  93.2  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  26.22 
 
 
571 aa  92.4  8e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  28.89 
 
 
303 aa  92  8e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 
277 aa  92.4  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 
311 aa  92.4  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 
288 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 
273 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3669  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
306 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 
322 aa  92  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3522  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
289 aa  91.3  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328717  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  25.94 
 
 
252 aa  91.3  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
270 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.14 
 
 
371 aa  90.5  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.27 
 
 
277 aa  90.1  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  27.7 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
345 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  27.7 
 
 
315 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1620  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 
303 aa  89.7  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
302 aa  90.1  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
288 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  29.73 
 
 
257 aa  89.7  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
275 aa  89.7  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 
317 aa  89.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
279 aa  89.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
309 aa  89  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.81 
 
 
265 aa  89  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1801  alpha/beta hydrolase fold  27.04 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
294 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>