More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4279 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
290 aa  586  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  83.69 
 
 
291 aa  485  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  71.48 
 
 
287 aa  404  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  66.55 
 
 
291 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  66.55 
 
 
291 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  66.55 
 
 
291 aa  392  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  69.31 
 
 
295 aa  361  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  47.12 
 
 
301 aa  258  7e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  47.86 
 
 
350 aa  256  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  47.14 
 
 
361 aa  254  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  48.01 
 
 
333 aa  247  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  45.8 
 
 
350 aa  239  4e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  48.16 
 
 
309 aa  238  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  43.17 
 
 
314 aa  236  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  47.81 
 
 
298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  45.52 
 
 
340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  45.52 
 
 
340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  43.73 
 
 
341 aa  232  5e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  45.52 
 
 
340 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  46.83 
 
 
340 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  46.29 
 
 
340 aa  230  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  43.06 
 
 
322 aa  211  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  33.71 
 
 
296 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  32.51 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 
308 aa  130  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.82 
 
 
372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  31.62 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  28.52 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  31.29 
 
 
340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 
286 aa  117  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
300 aa  117  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
281 aa  117  3e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  32.52 
 
 
284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 
316 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  28.16 
 
 
300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  27.99 
 
 
300 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  29.17 
 
 
339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  30.85 
 
 
276 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.6 
 
 
369 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  27.99 
 
 
300 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
287 aa  109  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  28.33 
 
 
300 aa  109  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  27.99 
 
 
300 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 
283 aa  109  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  27.99 
 
 
300 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  27.99 
 
 
300 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.12 
 
 
300 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1023  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 
284 aa  108  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
329 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
276 aa  107  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
345 aa  107  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 
280 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
315 aa  106  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.82 
 
 
367 aa  106  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
283 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
288 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 
284 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  31.02 
 
 
264 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 
323 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.29 
 
 
372 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  28.02 
 
 
309 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  29.78 
 
 
278 aa  103  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 
310 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  29.93 
 
 
302 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3237  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
284 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 
286 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  31.14 
 
 
292 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
287 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
287 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
287 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4453  alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
279 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 
268 aa  99.4  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.1 
 
 
285 aa  99.4  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  34.44 
 
 
290 aa  99.4  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.83 
 
 
271 aa  99  8e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  26.67 
 
 
313 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.08 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.83 
 
 
371 aa  97.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.16 
 
 
374 aa  97.1  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 
274 aa  96.7  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
295 aa  96.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  27.8 
 
 
266 aa  96.7  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.43 
 
 
288 aa  96.3  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 
265 aa  96.3  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
265 aa  96.3  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  32.36 
 
 
279 aa  96.3  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.66 
 
 
370 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  30.19 
 
 
298 aa  95.5  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0519  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
297 aa  95.5  9e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  26.8 
 
 
265 aa  95.5  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
346 aa  94.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 
291 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.48 
 
 
370 aa  95.1  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.66 
 
 
370 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>