More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2302 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
329 aa  662    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  90.24 
 
 
339 aa  600  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  54.19 
 
 
340 aa  364  1e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  59.04 
 
 
340 aa  362  4e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  57.05 
 
 
333 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  38.96 
 
 
323 aa  215  7e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
312 aa  202  8e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  37.79 
 
 
313 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  37.13 
 
 
313 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  38.41 
 
 
315 aa  193  3e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  38.28 
 
 
316 aa  175  8e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  35.8 
 
 
345 aa  169  4e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
339 aa  155  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 
312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  31.36 
 
 
312 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  31.01 
 
 
312 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
346 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 
304 aa  129  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 
287 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  31.76 
 
 
297 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  30.04 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  28.32 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 
291 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  31.4 
 
 
298 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
290 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 
296 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
275 aa  102  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0581  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 
275 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  28.89 
 
 
562 aa  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.83 
 
 
295 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
311 aa  99.4  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
291 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.72 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.26 
 
 
299 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  29.27 
 
 
299 aa  97.1  4e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0824  hypothetical protein  27.59 
 
 
252 aa  97.1  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.668362 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 
281 aa  95.9  9e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  29.58 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  29.58 
 
 
315 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  27.93 
 
 
279 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  27.42 
 
 
322 aa  94.7  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
361 aa  94  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  28.83 
 
 
279 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 
279 aa  93.6  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 
279 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  28.83 
 
 
279 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  28.83 
 
 
279 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  28.83 
 
 
279 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
301 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
274 aa  93.2  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 
275 aa  92.8  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  27.93 
 
 
279 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0656  alpha/beta hydrolase fold protein  27.76 
 
 
258 aa  92.4  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288607 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.1 
 
 
372 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3406  alpha/beta fold family hydrolase  25.19 
 
 
257 aa  90.9  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.470635 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
279 aa  90.1  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 
309 aa  90.1  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 
404 aa  89.7  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
314 aa  89.7  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.83 
 
 
369 aa  89  1e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
297 aa  89  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.68 
 
 
370 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  27.37 
 
 
279 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3893  alpha/beta hydrolase fold protein  25.19 
 
 
257 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 
301 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  27.66 
 
 
284 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  28.52 
 
 
275 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
280 aa  85.9  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4600  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 
286 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.413191  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  22.46 
 
 
287 aa  85.5  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  24.45 
 
 
284 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  26.09 
 
 
284 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.95 
 
 
368 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1811  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  25.19 
 
 
263 aa  85.5  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00537081  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.91 
 
 
295 aa  85.9  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  26.78 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.95 
 
 
368 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.35 
 
 
368 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 
285 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
504 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.67 
 
 
370 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  24.05 
 
 
254 aa  84  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4887  3-oxoadipate enol-lactonase  27.18 
 
 
397 aa  83.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.307912  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  26.48 
 
 
295 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2793  alpha/beta hydrolase fold protein  27.63 
 
 
281 aa  83.2  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  26.47 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4195  alpha/beta hydrolase fold protein  26.86 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
240 aa  82.8  0.000000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.7 
 
 
371 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.7 
 
 
371 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
296 aa  82.4  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 
299 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>