More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0725 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
286 aa  577  1e-164  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  55.16 
 
 
308 aa  307  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  41.92 
 
 
310 aa  226  4e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  34.01 
 
 
296 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 
350 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  31.87 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  32.94 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  32.94 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  32.94 
 
 
291 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
295 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 
361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  32.33 
 
 
462 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.67 
 
 
285 aa  113  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
340 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  31.6 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  26.59 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 
350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  27.74 
 
 
279 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 
279 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  29.09 
 
 
456 aa  109  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  27.74 
 
 
279 aa  109  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  27.74 
 
 
279 aa  109  6e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
333 aa  108  7.000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
309 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 
291 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
279 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
279 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  30.71 
 
 
462 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  29.45 
 
 
279 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  34.12 
 
 
299 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  29.57 
 
 
341 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  29.45 
 
 
279 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
314 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  34.32 
 
 
275 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  29.82 
 
 
279 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
279 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
317 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  29.62 
 
 
291 aa  103  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  28.32 
 
 
279 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.31 
 
 
284 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 
286 aa  102  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 
322 aa  102  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.96 
 
 
315 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  32.38 
 
 
275 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 
309 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  28.74 
 
 
275 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  30.26 
 
 
453 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 
302 aa  99.8  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  27.71 
 
 
262 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
340 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 
273 aa  99.4  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2343  alpha/beta hydrolase fold  33.1 
 
 
279 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302019  decreased coverage  0.000831021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  27.66 
 
 
340 aa  97.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 
301 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
278 aa  97.1  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 
345 aa  97.4  3e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  32.86 
 
 
290 aa  97.1  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  29.5 
 
 
307 aa  96.7  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
296 aa  96.7  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 
309 aa  96.3  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
267 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 
298 aa  96.3  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
287 aa  95.5  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  27.95 
 
 
310 aa  94.7  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3344  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 
289 aa  94.7  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.18 
 
 
370 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  29.69 
 
 
275 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  30.48 
 
 
279 aa  94.7  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 
260 aa  93.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  23.51 
 
 
277 aa  93.6  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 
291 aa  94  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29.88 
 
 
298 aa  93.6  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
256 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
287 aa  93.2  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 
283 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.88 
 
 
371 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  27.18 
 
 
288 aa  93.2  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  30.38 
 
 
283 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 
274 aa  92.8  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1155  alpha/beta hydrolase fold protein  31.53 
 
 
292 aa  92.8  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0476  Alpha/beta hydrolase  30.99 
 
 
330 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  32.98 
 
 
296 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.88 
 
 
371 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 
280 aa  92.4  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.88 
 
 
371 aa  92.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 
322 aa  92  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.83 
 
 
266 aa  92  9e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.43 
 
 
370 aa  92  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
283 aa  92  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>