More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12729 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  100 
 
 
341 aa  689    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  78.3 
 
 
340 aa  534  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  78.3 
 
 
340 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  78.3 
 
 
340 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  76.83 
 
 
340 aa  522  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  74.49 
 
 
340 aa  510  1e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  58.89 
 
 
350 aa  389  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  55.02 
 
 
361 aa  328  6e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  55.12 
 
 
350 aa  319  5e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  52.94 
 
 
309 aa  315  5e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  52.7 
 
 
314 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  50.33 
 
 
333 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  51.34 
 
 
301 aa  287  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  50.33 
 
 
322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  46.62 
 
 
291 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  46.62 
 
 
291 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  46.62 
 
 
291 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  43.73 
 
 
290 aa  232  6e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  44.84 
 
 
295 aa  228  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  45.55 
 
 
287 aa  223  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  43.62 
 
 
291 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  42.2 
 
 
298 aa  206  5e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 
296 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
345 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 
290 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 
339 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
283 aa  106  6e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 
286 aa  106  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  30.24 
 
 
284 aa  104  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
275 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
280 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 
276 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 
284 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  26.45 
 
 
281 aa  100  3e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 
315 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 
286 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.51 
 
 
372 aa  99.4  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  27.12 
 
 
300 aa  99  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 
271 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 
279 aa  99  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
504 aa  98.6  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  31.38 
 
 
304 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
300 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  27.04 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  26.25 
 
 
405 aa  97.8  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.71 
 
 
300 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  26.77 
 
 
291 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  27.14 
 
 
291 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
271 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 
290 aa  94  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  27.14 
 
 
291 aa  94  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  28.3 
 
 
257 aa  94.4  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  26.77 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  27.14 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  26.39 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  27.14 
 
 
291 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  27.04 
 
 
300 aa  94  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  28.47 
 
 
287 aa  93.6  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  27.04 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  27.04 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  27.04 
 
 
300 aa  93.2  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 
275 aa  93.2  5e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.1 
 
 
371 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
291 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.1 
 
 
371 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 
291 aa  93.2  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.85 
 
 
285 aa  92.8  7e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.1 
 
 
371 aa  92.8  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  28.66 
 
 
287 aa  92.8  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  27.04 
 
 
300 aa  92.4  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.11 
 
 
371 aa  92.4  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  40.62 
 
 
302 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  42.06 
 
 
282 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
272 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  40 
 
 
275 aa  92  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2792  alpha/beta hydrolase fold protein  24.83 
 
 
260 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.377437 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
316 aa  91.7  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0604  alpha/beta hydrolase fold  22.55 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.791043 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0148  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 
266 aa  90.5  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.443703  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.38 
 
 
300 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.81 
 
 
370 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
332 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  31.05 
 
 
276 aa  90.5  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  43.22 
 
 
290 aa  90.5  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 
265 aa  90.1  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  25.69 
 
 
288 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  27.97 
 
 
292 aa  90.1  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  40.71 
 
 
291 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  40.71 
 
 
291 aa  89.7  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  25.65 
 
 
290 aa  89.7  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  25.65 
 
 
257 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  25.65 
 
 
257 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  25.65 
 
 
257 aa  89.7  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  26.62 
 
 
257 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  26.39 
 
 
290 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  40.71 
 
 
291 aa  89.4  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  26.02 
 
 
290 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5882  alpha/beta hydrolase fold  28.11 
 
 
273 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4430  alpha/beta fold family hydrolase  26.49 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.12561  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  30.19 
 
 
283 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>