More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3731 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  100 
 
 
372 aa  746    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  63.34 
 
 
372 aa  483  1e-135  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  55.31 
 
 
371 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  54.7 
 
 
370 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  55.37 
 
 
367 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  50.41 
 
 
370 aa  338  9e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.86 
 
 
370 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  50.68 
 
 
371 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  47.97 
 
 
370 aa  335  9e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  47.58 
 
 
369 aa  332  7.000000000000001e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  47.7 
 
 
370 aa  329  4e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.04 
 
 
370 aa  328  7e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.23 
 
 
371 aa  328  9e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.89 
 
 
368 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.09 
 
 
371 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.09 
 
 
371 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  45.95 
 
 
370 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.89 
 
 
368 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5138  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  51.64 
 
 
371 aa  309  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184434  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.48 
 
 
368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  44.09 
 
 
380 aa  305  1.0000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1775  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  50.68 
 
 
371 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1748  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  50.41 
 
 
371 aa  302  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.572248  normal  0.0590997 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  46.49 
 
 
374 aa  298  9e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1087  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42.06 
 
 
389 aa  268  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.607916  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2228  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.73 
 
 
440 aa  138  1e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.47 
 
 
443 aa  129  9.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 
290 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0345  dihydrolipoamide acetyltransferase  57.01 
 
 
450 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  32.05 
 
 
291 aa  116  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 
291 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 
291 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
314 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  31.99 
 
 
291 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
299 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
299 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
299 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  29.55 
 
 
291 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 
290 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 
298 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 
288 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 
296 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 
289 aa  100  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 
283 aa  99.8  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  31.73 
 
 
340 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  30.51 
 
 
341 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 
316 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  32.27 
 
 
303 aa  99.4  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  29.56 
 
 
284 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1026  dehydrogenase catalytic domain-containing protein  49.12 
 
 
450 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138637  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  30.2 
 
 
254 aa  96.7  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 
333 aa  96.3  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 
287 aa  95.9  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 
295 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1572  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  32.76 
 
 
461 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 
299 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 
255 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  31.17 
 
 
311 aa  95.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
361 aa  94.4  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  30.92 
 
 
309 aa  94.4  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
279 aa  94  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
294 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0536  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.46 
 
 
398 aa  93.2  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13712  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
350 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
309 aa  92  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 
340 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 
340 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 
340 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
340 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.86 
 
 
343 aa  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
295 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3560  dehydrogenase catalytic domain-containing protein  48.39 
 
 
480 aa  91.3  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000824091  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1023  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
284 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
329 aa  91.3  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 
286 aa  90.9  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
293 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
350 aa  90.5  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3037  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.6 
 
 
437 aa  89.7  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  38.98 
 
 
262 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
339 aa  89.7  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  28.89 
 
 
562 aa  89.7  8e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
322 aa  89.7  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3237  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 
284 aa  89  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
288 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0105  alpha/beta hydrolase  29.45 
 
 
328 aa  88.6  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00875507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
315 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
299 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2256  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 
297 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2307  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 
297 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.960741 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
295 aa  87.4  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 
268 aa  87.8  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
301 aa  87  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
316 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
299 aa  87  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
285 aa  87  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>