More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5552 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  100 
 
 
370 aa  742    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  65.14 
 
 
371 aa  490  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  54.7 
 
 
372 aa  395  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  53.97 
 
 
372 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  54.47 
 
 
367 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.76 
 
 
370 aa  332  5e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.65 
 
 
371 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  47.25 
 
 
370 aa  325  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  47.68 
 
 
370 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  47.15 
 
 
370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  46.69 
 
 
369 aa  316  4e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  46.96 
 
 
370 aa  315  9e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  46.43 
 
 
370 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  47.43 
 
 
368 aa  311  9e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.77 
 
 
371 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.63 
 
 
371 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.63 
 
 
371 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  45.45 
 
 
374 aa  301  9e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  47.15 
 
 
368 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  47.44 
 
 
368 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  40.76 
 
 
380 aa  294  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5138  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  49.18 
 
 
371 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.184434  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1775  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.09 
 
 
371 aa  286  5e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1748  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  48.09 
 
 
371 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.572248  normal  0.0590997 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1087  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  42.15 
 
 
389 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.607916  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2228  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.71 
 
 
440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4115  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.15 
 
 
443 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1026  dehydrogenase catalytic domain-containing protein  61 
 
 
450 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138637  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0345  dihydrolipoamide acetyltransferase  57.14 
 
 
450 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
288 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  31.39 
 
 
299 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3037  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.31 
 
 
437 aa  107  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
284 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 
290 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  32.1 
 
 
314 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0317  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  50.51 
 
 
99 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.137506  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
299 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
299 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  30.68 
 
 
315 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
299 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
299 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  30.68 
 
 
315 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
299 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
299 aa  100  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
312 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 
296 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 
316 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 
299 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
315 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 
309 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 
298 aa  96.7  6e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  30.89 
 
 
276 aa  96.7  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 
333 aa  95.9  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
291 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
291 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  30.68 
 
 
291 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
361 aa  94  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 
316 aa  93.6  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 
316 aa  93.2  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
279 aa  93.2  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  28.3 
 
 
279 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
290 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  28.97 
 
 
310 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
295 aa  92  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 
340 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  29.73 
 
 
283 aa  91.7  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0536  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.08 
 
 
398 aa  91.7  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13712  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.51 
 
 
291 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  32.57 
 
 
265 aa  90.5  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  29.81 
 
 
341 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29.3 
 
 
339 aa  89.7  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
340 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 
312 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
340 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  32.08 
 
 
264 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  30.68 
 
 
255 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  27.52 
 
 
312 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 
262 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 
302 aa  87.4  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
262 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
345 aa  86.3  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
278 aa  86.3  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
287 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1968  putative alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
259 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153168  normal  0.143128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  27.5 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.29 
 
 
301 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3560  dehydrogenase catalytic domain-containing protein  43.52 
 
 
480 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000824091  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  31.39 
 
 
275 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
274 aa  84  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 
322 aa  84.3  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
312 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  30.29 
 
 
312 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 
290 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  28.9 
 
 
265 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
302 aa  84  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  29.55 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>