More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_5440 on replicon NC_008147
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 299 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  99.67 
 
 		 316 aa  604  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  97.32 
 
 		 299 aa  568  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  97.32 
 
 		 299 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  97.32 
 
 		 299 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  97.32 
 
 		 299 aa  568  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  97.32 
 
 		 299 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  97.32 
 
 		 299 aa  568  1e-161  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  96.66 
 
 		 299 aa  565  1e-160  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  41.5 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  38.85 
 
 		 287 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  38.85 
 
 		 287 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  38.51 
 
 		 287 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  37.84 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 288 aa  188  7e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  36.61 
 
 		 287 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2891  alpha/beta hydrolase fold  37.12 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.265351 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3549  HOMODA hydrolase (CmtE)  36.05 
 
 		 301 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1002  alpha/beta family hydrolase  33.9 
 
 		 292 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4067  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 304 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241995  normal  0.431683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 		 279 aa  132  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  34.28 
 
 		 282 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 277 aa  122  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  31.38 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 288 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  31.45 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4414  alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 		 279 aa  106  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 302 aa  105  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  30.6 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  31.39 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.92 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  28.1 
 
 		 277 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3250  Alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 273 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000000000180136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  29.02 
 
 		 289 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.07 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 		 296 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 288 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 		 288 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.86 
 
 		 275 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.28 
 
 		 367 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0380  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.02 
 
 		 288 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.615144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0424  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  29.02 
 
 		 288 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3276  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 		 288 aa  99.4  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.15708  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00303  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.67 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0321266  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00307  hypothetical protein  28.67 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0415585  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0373  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.67 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.170384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0413  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  28.67 
 
 		 293 aa  99.4  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 298 aa  98.6  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.58 
 
 		 370 aa  98.6  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 		 302 aa  98.6  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.6 
 
 		 369 aa  98.2  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 		 289 aa  97.8  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 283 aa  97.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.84 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 		 289 aa  96.7  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 315 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 283 aa  96.3  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  31.37 
 
 		 304 aa  96.3  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  27 
 
 		 294 aa  96.3  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 		 277 aa  96.3  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1981  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 287 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 350 aa  95.9  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  27.11 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 		 285 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 		 273 aa  94.4  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42230  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  30.91 
 
 		 271 aa  94  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 		 299 aa  94  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 339 aa  94  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 276 aa  93.6  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 285 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 285 aa  93.2  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 		 290 aa  92.4  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.47 
 
 		 372 aa  92  9e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4525  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 290 aa  92.4  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.212373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0648  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 		 226 aa  92  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0281045 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.37 
 
 		 372 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  27.6 
 
 		 295 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 271 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  32.01 
 
 		 276 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2898  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14294 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3228  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 		 281 aa  89.7  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 314 aa  89.7  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  31.07 
 
 		 278 aa  89  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  29.48 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  25.35 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>