More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06730 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  100 
 
 
343 aa  674    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  55.22 
 
 
344 aa  346  4e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  43.46 
 
 
327 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  45.64 
 
 
303 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  44.6 
 
 
304 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  40.66 
 
 
322 aa  204  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  42.22 
 
 
363 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4250  alpha/beta hydrolase fold protein  40.18 
 
 
352 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  38.85 
 
 
366 aa  168  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 
329 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  34.56 
 
 
304 aa  110  5e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  29.33 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  30.26 
 
 
315 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  30.26 
 
 
315 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
312 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.86 
 
 
372 aa  91.3  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  30.45 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
312 aa  91.7  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.99 
 
 
371 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  33.99 
 
 
371 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2433  hypothetical protein  29.37 
 
 
306 aa  89.4  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  31.32 
 
 
289 aa  89.4  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  33.97 
 
 
299 aa  89  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  34.22 
 
 
371 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 
284 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
311 aa  87  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.19 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  32.72 
 
 
268 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.42 
 
 
286 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  28.32 
 
 
456 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  32.58 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.78 
 
 
380 aa  83.2  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.68 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
289 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1721  alpha/beta fold family hydrolase  23 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0960045  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  27.33 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.24 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  26.67 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 
309 aa  79  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  27.38 
 
 
279 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 
287 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  27.73 
 
 
285 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 
279 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.63 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  26.94 
 
 
279 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  27 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  27 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  27 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2564  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0931  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
274 aa  77.4  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  30.8 
 
 
275 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  27 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  28.18 
 
 
284 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  27.38 
 
 
279 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2670  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 
298 aa  76.6  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00899476  normal  0.0694304 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  29.1 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.28 
 
 
331 aa  76.6  0.0000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.6 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18201  alpha/beta fold family hydrolase  21.95 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.392562  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  27 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
279 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  25.08 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3950  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 
474 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.96 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  27.07 
 
 
280 aa  75.9  0.0000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18381  alpha/beta fold family hydrolase  21.25 
 
 
304 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  25.26 
 
 
304 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.85 
 
 
258 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  30.71 
 
 
265 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2878  alpha/beta hydrolase fold  29.78 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  24.16 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  27.48 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  26.36 
 
 
311 aa  73.9  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 
504 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2863  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 
314 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4708  Alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00337944  normal  0.50622 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  30.6 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1937  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  29.21 
 
 
462 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  27.61 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1206  putative alpha/beta hydrolase superfamily  22.26 
 
 
299 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  26.26 
 
 
302 aa  72  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  25.7 
 
 
293 aa  72  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  29.21 
 
 
291 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>