More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0952 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 350 aa  684    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  77.54 
 
 		 361 aa  480  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  57.88 
 
 		 340 aa  326  3e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  57.88 
 
 		 340 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  57.88 
 
 		 340 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  56.29 
 
 		 340 aa  325  1e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  55.12 
 
 		 341 aa  319  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  52 
 
 		 314 aa  318  9e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  54.46 
 
 		 340 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  56.29 
 
 		 350 aa  307  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  51.34 
 
 		 333 aa  293  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  53.4 
 
 		 301 aa  287  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  53.1 
 
 		 309 aa  278  9e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  52.17 
 
 		 287 aa  263  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  48.76 
 
 		 295 aa  259  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  47.86 
 
 		 290 aa  256  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  46.74 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  46.08 
 
 		 291 aa  236  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  48.04 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  46.59 
 
 		 291 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  46.59 
 
 		 291 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  46.59 
 
 		 291 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  34.24 
 
 		 296 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  34.75 
 
 		 286 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  34.07 
 
 		 308 aa  129  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  35.23 
 
 		 284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 275 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  33.11 
 
 		 275 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 		 283 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  35.29 
 
 		 276 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  35.42 
 
 		 299 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  35.27 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2400  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 284 aa  110  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 287 aa  110  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  31.56 
 
 		 283 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 291 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  32.62 
 
 		 295 aa  107  4e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 		 281 aa  106  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.04 
 
 		 284 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 		 280 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 271 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4748  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 295 aa  103  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 291 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  30.31 
 
 		 264 aa  103  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  31.39 
 
 		 276 aa  102  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  29.97 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.2 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  25.69 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  25.69 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  25.69 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  24.11 
 
 		 290 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  32.49 
 
 		 310 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  26.37 
 
 		 291 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 		 286 aa  99.4  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  25.09 
 
 		 291 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  25.83 
 
 		 253 aa  98.6  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  26.33 
 
 		 290 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  24.74 
 
 		 291 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5552  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.65 
 
 		 370 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.077135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  25.98 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  28.12 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  24.39 
 
 		 291 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 298 aa  97.8  3e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  34.29 
 
 		 279 aa  97.8  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0627  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 299 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 277 aa  97.1  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0545  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 299 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1652  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 299 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1679  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 299 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5609  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 299 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.333622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1708  alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 		 299 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0456043  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 		 287 aa  96.7  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.5 
 
 		 371 aa  96.3  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 288 aa  95.9  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 271 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  32.18 
 
 		 312 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5440  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 299 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.341918 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5837  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.381935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0538  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.282885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 		 287 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  31.47 
 
 		 312 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  27.12 
 
 		 303 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>