More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2983 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
303 aa  597  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  68.94 
 
 
304 aa  394  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  51.02 
 
 
344 aa  259  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  45.64 
 
 
343 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  44.41 
 
 
327 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  44.28 
 
 
366 aa  192  5e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4250  alpha/beta hydrolase fold protein  42.52 
 
 
352 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  42.05 
 
 
363 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  40.28 
 
 
322 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  37.55 
 
 
304 aa  109  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.27 
 
 
372 aa  99.4  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 
315 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  30.68 
 
 
290 aa  93.2  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  36.47 
 
 
329 aa  92.8  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  31.87 
 
 
312 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  30.8 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  31.32 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.82 
 
 
380 aa  90.1  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  31.5 
 
 
312 aa  89.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
299 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
299 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 
299 aa  89.4  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 
311 aa  88.2  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.98 
 
 
299 aa  87.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  32 
 
 
295 aa  87  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  28.36 
 
 
295 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 
312 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 
273 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  30.04 
 
 
298 aa  85.9  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
299 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  26.46 
 
 
313 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 
284 aa  84  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  28.41 
 
 
289 aa  84  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2863  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
314 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  23.13 
 
 
345 aa  83.6  0.000000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.71 
 
 
372 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  26.71 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
312 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  28.36 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.34 
 
 
308 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  30.03 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  24.84 
 
 
285 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  26.94 
 
 
300 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  43.36 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
316 aa  77.8  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.95 
 
 
368 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  34.43 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.73 
 
 
370 aa  77  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
289 aa  77  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  27.99 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3833  alpha/beta hydrolase fold protein  30.47 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.549204 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  29.2 
 
 
297 aa  77  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 
290 aa  77  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.7 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 
339 aa  76.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.23 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  42.48 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  35.5 
 
 
268 aa  76.3  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  31.01 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 
282 aa  75.5  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.95 
 
 
368 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2675  alpha/beta fold family hydrolase  36.96 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0099  alpha/beta fold family hydrolase  36.81 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1076  hypothetical protein  36.96 
 
 
324 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.773392  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  26.15 
 
 
278 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 
286 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.41 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2822  alpha/beta fold family hydrolase  36.81 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.41 
 
 
371 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  34.91 
 
 
268 aa  75.1  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.54 
 
 
287 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0402  alpha/beta fold family hydrolase  36.81 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1260  alpha/beta fold family hydrolase  36.81 
 
 
327 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.809  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  27.86 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  28.78 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.94 
 
 
370 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 
273 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  32.01 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2445  Alpha/beta hydrolase  35.06 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.77 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  27.37 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  29.64 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2047  Alpha/beta hydrolase fold  25.78 
 
 
312 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.53 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  29.17 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  27.55 
 
 
295 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  28.96 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  41.59 
 
 
281 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>