More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1823 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 322 aa  638    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  57.48 
 
 		 309 aa  332  7.000000000000001e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  52.26 
 
 		 340 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  51.11 
 
 		 340 aa  300  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  50.79 
 
 		 340 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  50.79 
 
 		 340 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  50.33 
 
 		 341 aa  298  1e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  50.99 
 
 		 340 aa  294  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  51.39 
 
 		 350 aa  284  1.0000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  48.47 
 
 		 314 aa  280  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  48.01 
 
 		 333 aa  270  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  47.23 
 
 		 361 aa  260  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  45.87 
 
 		 350 aa  249  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  46.1 
 
 		 301 aa  240  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  43.06 
 
 		 290 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  46.07 
 
 		 291 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  46.07 
 
 		 291 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  46.07 
 
 		 291 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  44.21 
 
 		 287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  44.01 
 
 		 291 aa  212  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  43.01 
 
 		 295 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  41.09 
 
 		 298 aa  192  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  30.71 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  31.77 
 
 		 276 aa  115  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  30.95 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1114  alpha/beta hydrolase fold  32.14 
 
 		 405 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.060895  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  32.86 
 
 		 275 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 281 aa  106  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  29.62 
 
 		 287 aa  105  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 		 284 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  32.86 
 
 		 284 aa  102  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  31.34 
 
 		 292 aa  102  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  30.04 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 265 aa  99.8  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.59 
 
 		 309 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 339 aa  99  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 		 264 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.94 
 
 		 285 aa  96.3  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4235  alpha/beta hydrolase fold  32.96 
 
 		 252 aa  95.5  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 		 266 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 286 aa  95.5  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  28.62 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 280 aa  94.7  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 341 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 287 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 		 312 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  28.62 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  40.98 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  31.2 
 
 		 268 aa  93.2  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  31.02 
 
 		 290 aa  92.8  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  23.95 
 
 		 300 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  40.98 
 
 		 302 aa  92.4  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 278 aa  91.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  30.53 
 
 		 282 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  27.66 
 
 		 277 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2732  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 		 271 aa  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 316 aa  91.3  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4246  alpha/beta hydrolase fold  25.58 
 
 		 288 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.912428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1023  alpha/beta family hydrolase  26.62 
 
 		 287 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.55 
 
 		 372 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 		 302 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  24.57 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  30.93 
 
 		 271 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  25.72 
 
 		 257 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  25.72 
 
 		 257 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  25.72 
 
 		 257 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0208  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  29.79 
 
 		 266 aa  89.7  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0225  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 272 aa  89.7  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.701432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3791  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 287 aa  89.7  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  25.3 
 
 		 311 aa  89.4  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 363 aa  89.7  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 		 272 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 		 279 aa  89.4  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3787  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 287 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  24.05 
 
 		 300 aa  89  9e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3860  alpha/beta hydrolase fold  25.38 
 
 		 287 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1546  alpha/beta hydrolase fold  42.86 
 
 		 285 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.834926  hitchhiker  0.0047604 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  29.37 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 		 278 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2104  alpha/beta hydrolase fold  23.84 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0273  alpha/beta fold family hydrolase  23.64 
 
 		 258 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000365907  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  32.25 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  24.22 
 
 		 300 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.62 
 
 		 265 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  23.95 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  39.82 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 		 271 aa  87  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  23.95 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  23.95 
 
 		 300 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>