More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1023 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1023  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 284 aa  577  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3237  alpha/beta hydrolase fold protein  94.37 
 
 		 284 aa  520  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  40.15 
 
 		 302 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  38.29 
 
 		 297 aa  204  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  30.51 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 290 aa  118  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  32.99 
 
 		 301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 		 283 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31 
 
 		 372 aa  105  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.76 
 
 		 345 aa  103  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.3 
 
 		 287 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 		 276 aa  102  9e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 340 aa  101  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.99 
 
 		 339 aa  101  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 275 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 291 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  28.98 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  28.73 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 315 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 		 286 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  26.22 
 
 		 280 aa  99.8  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 340 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  28.73 
 
 		 312 aa  99.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 340 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 340 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  31.6 
 
 		 279 aa  99.4  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  31.6 
 
 		 279 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 		 279 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  31.6 
 
 		 279 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  31.6 
 
 		 279 aa  99.4  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 274 aa  99  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  31.6 
 
 		 279 aa  99  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 		 350 aa  98.6  9e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.93 
 
 		 350 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  30.83 
 
 		 289 aa  98.2  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  30.94 
 
 		 279 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  31.23 
 
 		 279 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  30.66 
 
 		 340 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  30.51 
 
 		 321 aa  96.7  4e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  31.18 
 
 		 341 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  30.42 
 
 		 279 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 361 aa  95.5  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  30.86 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  23.49 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 		 281 aa  93.2  5e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 304 aa  91.3  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 329 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 		 333 aa  90.9  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.76 
 
 		 314 aa  91.3  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  28.73 
 
 		 298 aa  90.5  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 		 340 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  27.87 
 
 		 284 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  29.08 
 
 		 272 aa  89.7  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12291  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  29.09 
 
 		 314 aa  89.7  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.230959  normal  0.0906885 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 		 309 aa  89.7  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 		 291 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 		 291 aa  89  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.75 
 
 		 312 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  27.41 
 
 		 340 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08481  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  30.28 
 
 		 335 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 		 272 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  31.34 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0420  alpha/beta hydrolase  28.52 
 
 		 319 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  32.25 
 
 		 304 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  27.24 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 		 322 aa  87  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  25.46 
 
 		 277 aa  86.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  29.85 
 
 		 304 aa  86.3  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  26.45 
 
 		 313 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  25.54 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  31.2 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  27.45 
 
 		 271 aa  84.7  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  27.48 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  25.97 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 275 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 		 285 aa  83.2  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 312 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 		 421 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  28.01 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1937  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 		 299 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13301  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  26.67 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  26.52 
 
 		 303 aa  82  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  26.77 
 
 		 285 aa  82  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  31.3 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 		 246 aa  82  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0986  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.900551 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  26.1 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  26.22 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4141  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 		 286 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0556153  normal  0.121245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  25.83 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>