More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3143 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 309 aa  602  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  85.99 
 
 		 315 aa  509  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 		 312 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  34.55 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  34.18 
 
 		 312 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  29.01 
 
 		 279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  29.01 
 
 		 279 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  28.63 
 
 		 279 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 		 279 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  27.97 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  27.97 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  27.97 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  27.97 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 		 279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  28.35 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  28.24 
 
 		 279 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 339 aa  119  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 		 284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  30.66 
 
 		 275 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  31.42 
 
 		 313 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  31.42 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3858  alpha/beta hydrolase fold  30.91 
 
 		 304 aa  102  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 		 285 aa  101  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 297 aa  100  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 312 aa  100  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  27.12 
 
 		 323 aa  99.4  8e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3690  alpha/beta hydrolase fold  31.74 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  35.04 
 
 		 374 aa  98.6  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 315 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  30.45 
 
 		 279 aa  96.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 345 aa  95.9  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  29.46 
 
 		 363 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 274 aa  94.7  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  29.17 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  32.6 
 
 		 289 aa  94  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.9 
 
 		 284 aa  92.4  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1361  Alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 298 aa  92.4  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00841082  hitchhiker  0.00000857461 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  30.9 
 
 		 293 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  30.53 
 
 		 297 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 		 279 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 316 aa  92  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3537  hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  33.01 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0692853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  28.83 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0161559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.43 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 288 aa  90.5  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0911  Alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 289 aa  89.7  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0219257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  28.77 
 
 		 289 aa  89.7  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 288 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  25.96 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15080  2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase  30.85 
 
 		 288 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.625795  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  30.24 
 
 		 289 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  23.86 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 271 aa  87.4  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0420  alpha/beta hydrolase  30.11 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  31.77 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0312  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 		 285 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  30.43 
 
 		 321 aa  86.7  5e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  41.04 
 
 		 351 aa  86.3  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0683  putative hydrolase  29.96 
 
 		 271 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 284 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 316 aa  86.3  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 289 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 283 aa  86.3  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  30.94 
 
 		 298 aa  85.9  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1248  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.15 
 
 		 311 aa  85.5  9e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 		 323 aa  85.9  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 		 346 aa  85.1  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 		 308 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  28.37 
 
 		 288 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  25.72 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 340 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  27.91 
 
 		 323 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  27.74 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  29.18 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0333  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.240836 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4012  Alpha/beta hydrolase  30.77 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2364  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 		 352 aa  84  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0988842 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  29.69 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  29.51 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 		 283 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 287 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  29.51 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  37.87 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  27.82 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  29.32 
 
 		 453 aa  82.8  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1420  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 320 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 		 340 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08481  putative alpha/beta hydrolase superfamily protein  29.77 
 
 		 335 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0669  epoxide hydrolase, putative  27.24 
 
 		 320 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1644  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>