More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0990 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
298 aa  615  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  40.59 
 
 
272 aa  202  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  41.6 
 
 
272 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  41.51 
 
 
272 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  36.82 
 
 
274 aa  175  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  36.47 
 
 
276 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6254  alpha/beta hydrolase fold protein  38.17 
 
 
277 aa  162  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 
267 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  39.31 
 
 
271 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 
275 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3192  alpha/beta hydrolase fold  38.55 
 
 
267 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  36.25 
 
 
284 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3137  alpha/beta hydrolase fold  38.82 
 
 
271 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3153  alpha/beta hydrolase fold  38.17 
 
 
271 aa  152  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0769848 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2524  alpha/beta hydrolase fold  38.43 
 
 
271 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191212  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
275 aa  139  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  31.5 
 
 
278 aa  119  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15020  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.16 
 
 
297 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232435  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  33.58 
 
 
279 aa  115  7.999999999999999e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  28.87 
 
 
284 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
283 aa  96.3  6e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
276 aa  94.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 
312 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0430  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 
296 aa  91.7  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  24.47 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3237  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 
284 aa  88.6  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  25.61 
 
 
299 aa  87.4  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1023  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
284 aa  86.7  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  22.57 
 
 
289 aa  85.9  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 
271 aa  85.9  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
291 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
291 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 
284 aa  85.9  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
291 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  28.63 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15323  predicted protein  27.08 
 
 
272 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155902  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1179  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0798469  normal  0.0102944 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  26.46 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2944  alpha/beta hydrolase fold  25.43 
 
 
300 aa  82.8  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.765765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3338  alpha/beta hydrolase fold  25.63 
 
 
271 aa  83.2  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  27.17 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  25.09 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
350 aa  82.4  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  26.5 
 
 
314 aa  82.4  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  26.44 
 
 
286 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  24.56 
 
 
287 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10077  oxidoreductase  27.51 
 
 
276 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  26.06 
 
 
295 aa  82  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  26.46 
 
 
279 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  25.68 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  26.76 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0199  alpha/beta hydrolase fold protein  27.45 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355967  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 
279 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4900  alpha/beta hydrolase fold  26.81 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000488276 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  25.68 
 
 
279 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 
284 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  24.64 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5550  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
281 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  25.68 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  25.68 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  25.68 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  25.68 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  25.68 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  29.21 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  25.49 
 
 
279 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5169  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  29.21 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5258  alpha/beta hydrolase fold  24.71 
 
 
281 aa  79.7  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.976099  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  29.21 
 
 
304 aa  79  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
277 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
340 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  26.18 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 
297 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  28.33 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2323  putative 2-hydroxy-6-ketonona-2,4-dienedioic acid hydrolase (MhpC)  23.64 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3438  3-oxoadipate enol-lactonase  27.59 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.221809  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4541  alpha/beta hydrolase fold protein  22.66 
 
 
288 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.707016  normal  0.231702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
277 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  24.81 
 
 
302 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  30.35 
 
 
315 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  27.42 
 
 
282 aa  77  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1248  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.31 
 
 
311 aa  77  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  22.68 
 
 
296 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
288 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  27.55 
 
 
292 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  27.69 
 
 
299 aa  77  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1028  hypothetical protein  25.61 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 
270 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  23.75 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  26.52 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>