More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1491 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
297 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  74.66 
 
 
298 aa  457  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  70.53 
 
 
302 aa  426  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  67.15 
 
 
301 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  63.35 
 
 
299 aa  380  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1412  alpha/beta fold family hydrolase  59.01 
 
 
295 aa  355  6.999999999999999e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.405065 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  52.23 
 
 
296 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 
315 aa  122  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  29.11 
 
 
313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  29.11 
 
 
313 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 
312 aa  106  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
308 aa  104  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
308 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
278 aa  102  9e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2782  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 
325 aa  100  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2945  alpha/beta hydrolase fold protein  27.46 
 
 
330 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  28.18 
 
 
284 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
279 aa  96.3  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0307  hypothetical protein  27.17 
 
 
264 aa  96.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  28.62 
 
 
279 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3317  putative hydrolase or acyltransferase  27.3 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3421  putative hydrolase or acyltransferase  27.3 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0121666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3325  putative hydrolase or acyltransferase  27.49 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0252993  normal  0.633189 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  29.15 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2830  Alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 
257 aa  93.6  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 
312 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3241  putative hydrolase or acyltransferase  27.3 
 
 
296 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 
332 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  26.28 
 
 
312 aa  93.2  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 
277 aa  92.8  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 
346 aa  92.4  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
287 aa  92.4  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.94 
 
 
345 aa  91.7  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 
309 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  29.25 
 
 
296 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  25.94 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
354 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  24.13 
 
 
290 aa  90.1  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  28.92 
 
 
273 aa  90.1  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  24.4 
 
 
297 aa  89.4  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 
279 aa  89.4  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  28.08 
 
 
329 aa  89  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  24.48 
 
 
275 aa  89  9e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1754  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
277 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  27.1 
 
 
302 aa  87  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6057  alpha/beta hydrolase fold  27.53 
 
 
332 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00402067  normal  0.493992 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  23.43 
 
 
290 aa  87  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  23.43 
 
 
291 aa  86.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
339 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 
332 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  22.81 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  23.43 
 
 
291 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  23.72 
 
 
291 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.58 
 
 
339 aa  86.3  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49180  Alpha/beta hydrolase fold protein  26.8 
 
 
321 aa  86.3  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  23.43 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  22.46 
 
 
291 aa  85.9  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  22.46 
 
 
291 aa  85.9  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2274  2-hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  27.18 
 
 
291 aa  85.9  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  27.08 
 
 
274 aa  85.9  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
286 aa  85.9  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  24.37 
 
 
286 aa  85.5  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 
288 aa  85.5  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
283 aa  85.5  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  29.41 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  29.45 
 
 
266 aa  85.1  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  29.56 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  23.08 
 
 
291 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0502  alpha/beta hydrolase fold  23.64 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  25.53 
 
 
562 aa  84.7  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  27.18 
 
 
304 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  26.41 
 
 
280 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5011  putative alpha/beta hydrolase  25.42 
 
 
350 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.418737  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4196  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2141  alpha/beta hydrolase fold  28.07 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  25.93 
 
 
340 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  23.93 
 
 
275 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2456  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 
278 aa  84  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0153839  normal  0.505758 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 
332 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  26.9 
 
 
284 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0291  hypothetical protein  23.91 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  26.24 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4468  hydrolase, alpha/beta fold family  25.86 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1512  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1316  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 
311 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.541831  normal  0.727397 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
323 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  26.61 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
316 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1011  alpha/beta hydrolase fold  35.57 
 
 
322 aa  82.4  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.99925 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
274 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1217  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1826  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 
285 aa  81.6  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363916  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.74 
 
 
265 aa  82  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  27.37 
 
 
282 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
350 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7536  Alpha/beta hydrolase  27.02 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>