More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2266 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2266  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 274 aa  535  1e-151  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.620512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1418  alpha/beta hydrolase fold protein  56.02 
 
 		 276 aa  289  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.961025  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4957  alpha/beta hydrolase fold  53.7 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.0565751 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2806  alpha/beta hydrolase fold protein  54.78 
 
 		 284 aa  284  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.645937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1693  putative hydrolase  52.24 
 
 		 272 aa  276  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.800205 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3261  alpha/beta hydrolase fold protein  50.93 
 
 		 272 aa  274  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767293  normal  0.718789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1065  alpha/beta hydrolase fold  53.44 
 
 		 275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.289777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3137  alpha/beta hydrolase fold  47.35 
 
 		 271 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2524  alpha/beta hydrolase fold  47.35 
 
 		 271 aa  229  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191212  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3192  alpha/beta hydrolase fold  47.35 
 
 		 267 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6254  alpha/beta hydrolase fold protein  44.81 
 
 		 277 aa  228  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3153  alpha/beta hydrolase fold  47.35 
 
 		 271 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0769848 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6488  Alpha/beta hydrolase  48.05 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3075  alpha/beta hydrolase fold  46.97 
 
 		 267 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15020  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  51.04 
 
 		 297 aa  207  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  36.82 
 
 		 298 aa  175  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  34.38 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  33.47 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  33.84 
 
 		 287 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2354  alpha/beta hydrolase fold protein  35.04 
 
 		 279 aa  105  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0658883  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1108  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 246 aa  106  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00367251  hitchhiker  0.00365287 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 275 aa  105  1e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  32.7 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 		 333 aa  97.1  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  31.15 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  28.68 
 
 		 329 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 298 aa  92.4  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 345 aa  90.1  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  32.17 
 
 		 308 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 310 aa  90.1  3e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  29.93 
 
 		 289 aa  89.4  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  28 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 		 350 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 		 381 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  27.13 
 
 		 339 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1023  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 		 284 aa  86.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 297 aa  85.9  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  30.11 
 
 		 341 aa  85.5  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  28.16 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0420  alpha/beta hydrolase  30.31 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  34.18 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  32.57 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01651  putative alpha/beta hydrolase superfamily  27.3 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0847  alpha/beta hydrolase fold protein  32.3 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.135304  normal  0.159023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 		 361 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  25.47 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.39 
 
 		 370 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.04 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  28.81 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  31.03 
 
 		 269 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.36 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.11 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  28.29 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0892  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0423954 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  23.75 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3237  alpha/beta hydrolase fold protein  26.76 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  31.43 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.05 
 
 		 339 aa  79.3  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  23.92 
 
 		 313 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  31.05 
 
 		 316 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  30.55 
 
 		 298 aa  79  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  31.05 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  31.94 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  31.05 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  26.1 
 
 		 562 aa  78.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  31.7 
 
 		 289 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 		 340 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  32.59 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  30.18 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  22.83 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  30.71 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3235  alpha/beta hydrolase fold  24.04 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423188  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  21.69 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0912  alpha/beta hydrolase fold  28.04 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4983  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.17 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.40688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  31.95 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0902  Alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0430  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  30.28 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  31.32 
 
 		 266 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>