More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8386 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  100 
 
 
304 aa  595  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  68.94 
 
 
303 aa  394  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  48.25 
 
 
344 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  45.94 
 
 
327 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  43.38 
 
 
343 aa  209  5e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  42.8 
 
 
366 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4250  alpha/beta hydrolase fold protein  41.47 
 
 
352 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  40.59 
 
 
363 aa  179  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  39.09 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  29.43 
 
 
273 aa  92.8  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
312 aa  92.8  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  31.27 
 
 
312 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  30.04 
 
 
302 aa  91.3  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  31.83 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  34.12 
 
 
299 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 
297 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.67 
 
 
372 aa  86.7  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  32.1 
 
 
304 aa  86.7  5e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  32.73 
 
 
308 aa  86.3  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 
311 aa  84  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  36.15 
 
 
329 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  30.45 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22460  alpha/beta family hydrolase  42.02 
 
 
275 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.241397  hitchhiker  0.0000000538784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.95 
 
 
380 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  29.09 
 
 
262 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
315 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  29.8 
 
 
372 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  30.71 
 
 
462 aa  80.5  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2863  alpha/beta hydrolase fold protein  31.21 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0656  Alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.198236  decreased coverage  0.00768241 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1900  putative hydrolase  42.11 
 
 
275 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.118605  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 
295 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2527  esterase-like  27.69 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  29.02 
 
 
289 aa  77  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0627  Alpha/beta hydrolase  29.59 
 
 
289 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.355065 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  25.79 
 
 
283 aa  76.6  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  26.53 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1240  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 
295 aa  75.5  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1827  alpha/beta hydrolase fold  24.65 
 
 
285 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.83 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  25.68 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 
284 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0527  inner-membrane translocator  26.79 
 
 
562 aa  74.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  25.56 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2328  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
270 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.674989  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4501  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.569639  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  28.52 
 
 
291 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1155  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.5 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1023  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
284 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  31.06 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0937  alpha/beta hydrolase fold protein  26.05 
 
 
300 aa  72.8  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35123  predicted protein  27.3 
 
 
348 aa  72.4  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  38.93 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  22.22 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  22.76 
 
 
323 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  27.99 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  23.08 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
504 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  28.67 
 
 
462 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  25.34 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2534  alpha/beta hydrolase fold  26.87 
 
 
330 aa  71.2  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0434  alpha/beta hydrolase fold  28.97 
 
 
318 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332302  hitchhiker  0.0000000111123 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5093  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.284245 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4895  alpha/beta hydrolase fold  31.74 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0335992  normal  0.294667 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2433  hypothetical protein  27.08 
 
 
306 aa  70.5  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4708  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 
350 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4794  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3689  alpha/beta hydrolase fold protein  26.3 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2775  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.562879  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  25.46 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1464  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03823  Alpha/beta hydrolase fold protein  23.39 
 
 
310 aa  69.7  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3237  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1759  Alpha/beta hydrolase fold hydrolase or acyltransferase  26.12 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11889  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0446  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 
318 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.2537  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6042  alpha/beta hydrolase fold  29.64 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567915  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
315 aa  68.9  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 
270 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  27.39 
 
 
298 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 
335 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  27.09 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 
291 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.82 
 
 
296 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4750  alpha/beta hydrolase fold protein  31.92 
 
 
268 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5307  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 
295 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224347 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1981  alpha/beta hydrolase fold protein  32.93 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.141718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0323  alpha/beta hydrolase fold  27.38 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  37.11 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>