More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2863 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2863  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
314 aa  592  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  43.6 
 
 
329 aa  176  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  41.18 
 
 
304 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
344 aa  97.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  33.7 
 
 
363 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
303 aa  89.4  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4250  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 
352 aa  87  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  31.21 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  28.95 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  32.96 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  31.69 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.58 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  31.69 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  29.97 
 
 
462 aa  79.3  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2073  alpha/beta hydrolase fold protein  39.52 
 
 
229 aa  78.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  29.62 
 
 
462 aa  79  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  40.77 
 
 
299 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  37.76 
 
 
310 aa  75.9  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 
322 aa  72.8  0.000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
317 aa  72.8  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.78 
 
 
265 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
286 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  39.39 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18381  alpha/beta fold family hydrolase  24.74 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0147  alpha/beta hydrolase  28.62 
 
 
282 aa  70.5  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0068  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  29.2 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.392587  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.11 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  38.66 
 
 
316 aa  70.1  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  29.22 
 
 
350 aa  69.3  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  27.72 
 
 
456 aa  69.7  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0626  Alpha/beta hydrolase fold  28.26 
 
 
308 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4708  Alpha/beta hydrolase fold  27.68 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00337944  normal  0.50622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  27.9 
 
 
290 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  38.51 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  24.55 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  28.21 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
287 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  24.82 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  29.33 
 
 
341 aa  68.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0675  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0467323 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5449  alpha/beta hydrolase fold  38.74 
 
 
272 aa  67.8  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.343862 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
504 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0356  alpha/beta hydrolase fold  42.16 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122696  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1248  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  26.06 
 
 
311 aa  67  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.74 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  40.71 
 
 
275 aa  67.4  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  24.82 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  40.57 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2097  alpha/beta hydrolase fold  28.53 
 
 
281 aa  67  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.421865  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  23.43 
 
 
281 aa  67  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34.07 
 
 
346 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  38.74 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 
363 aa  66.2  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25.55 
 
 
270 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 
304 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3023  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299925 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  29.84 
 
 
327 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  24.46 
 
 
270 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  24.46 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6084  hydrolase  45.19 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  23.81 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  24.46 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3781  alpha/beta hydrolase fold  36 
 
 
293 aa  64.7  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.668878  normal  0.527561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
268 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  23.81 
 
 
291 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  24.46 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5402  3-oxoadipate enol-lactonase  32.12 
 
 
255 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  42.02 
 
 
281 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1972  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  39.02 
 
 
263 aa  63.9  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  33.88 
 
 
255 aa  63.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_13371  predicted protein  25.77 
 
 
323 aa  63.9  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.014385  normal  0.0363767 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2242  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 
301 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.545637  normal  0.560868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1572  alpha/beta hydrolase fold  39.81 
 
 
306 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 
270 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
273 aa  63.9  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1701  alpha/beta hydrolase fold protein  24 
 
 
303 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25920  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37.04 
 
 
351 aa  63.5  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84065  normal  0.959468 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  24.15 
 
 
258 aa  63.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3669  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
306 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09891  Alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
299 aa  63.5  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  37.7 
 
 
312 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  25.9 
 
 
280 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3415  alpha/beta hydrolase fold  40.68 
 
 
256 aa  63.2  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  25.81 
 
 
300 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  32.93 
 
 
260 aa  62.8  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1683  hydrolase  28.14 
 
 
257 aa  62.8  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000746451  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.85 
 
 
371 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0778  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
290 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.588108  normal  0.620375 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  32.85 
 
 
371 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0234  hypothetical protein  28.57 
 
 
330 aa  62.4  0.000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.833519 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  28.89 
 
 
366 aa  62.4  0.000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  29.56 
 
 
308 aa  62.4  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1387  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  29.75 
 
 
288 aa  62  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.196692  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2496  alpha/beta hydrolase fold  41.82 
 
 
431 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>