More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1387 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1387  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  100 
 
 
288 aa  566  1e-160  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.196692  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1625  putative 2-hydroxy-6-oxohepta-2,4-dienoate hydrolase  77.43 
 
 
288 aa  442  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.997053  normal  0.416685 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09891  Alpha/beta hydrolase fold  63.73 
 
 
299 aa  358  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0662  alpha/beta fold family hydrolase  49.29 
 
 
302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.212326  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14941  Alpha/beta hydrolase fold  48.93 
 
 
302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0521265  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10991  Alpha/beta hydrolase fold  48.52 
 
 
291 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.312189 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11771  Alpha/beta hydrolase fold  44.84 
 
 
299 aa  266  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11921  Alpha/beta hydrolase fold  44.17 
 
 
310 aa  249  4e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1097  alpha/beta hydrolase fold protein  44.17 
 
 
299 aa  246  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11931  Alpha/beta hydrolase fold  43.46 
 
 
299 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  39.84 
 
 
303 aa  163  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  35.88 
 
 
291 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  36.26 
 
 
291 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  38.65 
 
 
290 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1937  alpha/beta hydrolase fold protein  37.94 
 
 
299 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4708  Alpha/beta hydrolase fold  34.15 
 
 
295 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00337944  normal  0.50622 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  32.04 
 
 
295 aa  145  7.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3023  alpha/beta hydrolase fold  35.63 
 
 
294 aa  144  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299925 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35123  predicted protein  31.33 
 
 
348 aa  107  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31408  predicted protein  31.17 
 
 
386 aa  91.3  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
315 aa  89.7  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3024  alpha/beta hydrolase fold protein  33.07 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  hitchhiker  0.00214769 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 
296 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1306  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258208  normal  0.0573899 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
314 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1565  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.461626  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.3 
 
 
301 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0809  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
283 aa  77  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3545  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.158387  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4621  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 
283 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  39.45 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  39.45 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
297 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  39.45 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  39.45 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  39.81 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15323  predicted protein  27.56 
 
 
272 aa  73.6  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00155902  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  39.81 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1183  Alpha/beta hydrolase  26.74 
 
 
279 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330922  normal  0.0773535 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3083  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
292 aa  73.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000632175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  39.45 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  40.71 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  40.74 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1331  Alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
278 aa  72.4  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000258733 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0221  alpha/beta hydrolase fold  27.91 
 
 
286 aa  72.4  0.000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2786  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.200125 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  27.24 
 
 
302 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  25.37 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  39.45 
 
 
270 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
312 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 
299 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  25.1 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1071  alpha/beta hydrolase fold protein  30.12 
 
 
265 aa  70.1  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  29.52 
 
 
290 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0994  alpha/beta hydrolase fold  22.44 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.795664 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  23.11 
 
 
291 aa  69.3  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3527  alpha/beta hydrolase fold protein  38.52 
 
 
294 aa  69.3  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4183  alpha/beta hydrolase fold  35.2 
 
 
279 aa  69.3  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.221808 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3110  alpha/beta hydrolase fold protein  28.4 
 
 
304 aa  68.9  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  34.67 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  26.56 
 
 
273 aa  68.9  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4624  alpha/beta fold family hydrolase  37.41 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.186809  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4484  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 
301 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3858  alpha/beta hydrolase fold  32.19 
 
 
283 aa  68.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167759  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  27.61 
 
 
275 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  27.67 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
287 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  24.6 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  37.3 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  31.16 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 
277 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1691  hypothetical protein  23.13 
 
 
299 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3663  alpha/beta hydrolase fold  27.64 
 
 
304 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30576  normal  0.0729234 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1638  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25.6 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1843  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00347923  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3786  Alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00563208  hitchhiker  0.00293132 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 
333 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3055  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 
277 aa  67  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5901  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  28.46 
 
 
308 aa  67  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  34.9 
 
 
270 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
350 aa  66.6  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1389  alpha/beta hydrolase fold protein  31.71 
 
 
287 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.48672  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 
340 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.3 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  30.2 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  30.15 
 
 
270 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>