More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1166 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 333 aa  690    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  62.88 
 
 		 331 aa  446  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  60.12 
 
 		 333 aa  430  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  60.49 
 
 		 330 aa  424  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  52.02 
 
 		 381 aa  362  4e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  52.46 
 
 		 345 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  52.63 
 
 		 341 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  51.48 
 
 		 368 aa  346  4e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  51.15 
 
 		 344 aa  344  1e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  50.82 
 
 		 344 aa  342  7e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  50.5 
 
 		 333 aa  342  8e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  49.5 
 
 		 333 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  50.16 
 
 		 406 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  48.62 
 
 		 332 aa  334  1e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  51.32 
 
 		 377 aa  334  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  51.15 
 
 		 341 aa  333  3e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  52.17 
 
 		 877 aa  332  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  52.17 
 
 		 342 aa  331  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  50.99 
 
 		 344 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  48.62 
 
 		 332 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  51.16 
 
 		 387 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  52.17 
 
 		 404 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  52.17 
 
 		 404 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  52.17 
 
 		 439 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  52.17 
 
 		 441 aa  330  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  51.16 
 
 		 353 aa  329  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  51.16 
 
 		 353 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  51.16 
 
 		 353 aa  329  4e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  46.93 
 
 		 332 aa  328  9e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  50.83 
 
 		 352 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 		 329 aa  326  3e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  47.35 
 
 		 332 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  50.66 
 
 		 429 aa  324  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  49.34 
 
 		 387 aa  324  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  48.84 
 
 		 335 aa  323  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  50.5 
 
 		 352 aa  322  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  49.02 
 
 		 332 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  46.75 
 
 		 350 aa  321  9.000000000000001e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  49.02 
 
 		 332 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  50.17 
 
 		 353 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  49.34 
 
 		 348 aa  319  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  46.81 
 
 		 348 aa  318  9e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  49.5 
 
 		 339 aa  317  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  50 
 
 		 355 aa  311  6.999999999999999e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  46.25 
 
 		 331 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  46.18 
 
 		 331 aa  301  9e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  43.8 
 
 		 346 aa  291  1e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  44.65 
 
 		 330 aa  281  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  43.28 
 
 		 336 aa  271  8.000000000000001e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  39.94 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  40.91 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  39.7 
 
 		 336 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  38.96 
 
 		 340 aa  230  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  38.96 
 
 		 343 aa  230  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  38.41 
 
 		 340 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3528  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  30.04 
 
 		 518 aa  95.5  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  29.3 
 
 		 276 aa  89.7  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  26.55 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  29.86 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  29.86 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  29.38 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  25.72 
 
 		 275 aa  82.4  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  29.86 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  29.86 
 
 		 291 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  29.86 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.27 
 
 		 300 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3307  alpha/beta fold family hydrolase  26.27 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  26.98 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3303  3-Oxoadipate enol-lactonase  26.27 
 
 		 300 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.664184  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  26.06 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  27.62 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  28.04 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3011  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 		 300 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245192  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3084  3-oxoadipate enol-lactonase  26.5 
 
 		 300 aa  80.1  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473381  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  29.38 
 
 		 290 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0180  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 		 831 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.9608 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  30.14 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3515  alpha/beta hydrolase fold protein  37.72 
 
 		 293 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  31.85 
 
 		 302 aa  77.4  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2995  3-oxoadipate enol-lactonase  26.03 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000386793  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3320  hydrolase, alpha/beta fold family  26.03 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  36.44 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3098  alpha/beta fold family hydrolase  26.03 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.833481  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3343  alpha/beta fold family hydrolase  26.03 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  25.87 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  25.95 
 
 		 277 aa  77  0.0000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0935  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423109  normal  0.641404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  31.51 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  27.27 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3313  3-Oxoadipate enol-lactonase  25.95 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4067  alpha/beta hydrolase fold  23.55 
 
 		 304 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.241995  normal  0.431683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  34.56 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  31.11 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.240082 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>