More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_24610 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  100 
 
 
333 aa  688    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  94.59 
 
 
333 aa  657    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  71.52 
 
 
341 aa  478  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  69.45 
 
 
406 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  66.87 
 
 
377 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  64.31 
 
 
332 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  69.06 
 
 
439 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  69.06 
 
 
404 aa  447  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  65.08 
 
 
332 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  68.39 
 
 
342 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  68.06 
 
 
429 aa  448  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  69.06 
 
 
441 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  69.06 
 
 
404 aa  448  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  63.27 
 
 
332 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  69.06 
 
 
877 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  66.88 
 
 
353 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  66.88 
 
 
332 aa  442  1e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  67.2 
 
 
353 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  63.81 
 
 
387 aa  444  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  67.2 
 
 
387 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  68.06 
 
 
353 aa  444  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  67.2 
 
 
353 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  62.04 
 
 
332 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  65.91 
 
 
332 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  62.42 
 
 
341 aa  434  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  64.5 
 
 
344 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  65.33 
 
 
348 aa  434  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  66.13 
 
 
352 aa  435  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  67.43 
 
 
348 aa  434  1e-120  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  65.81 
 
 
352 aa  434  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  64.31 
 
 
335 aa  434  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  66.12 
 
 
355 aa  423  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  61.54 
 
 
350 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  63.84 
 
 
339 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  62.27 
 
 
331 aa  413  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  60.25 
 
 
331 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  52.61 
 
 
333 aa  348  9e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  57 
 
 
344 aa  345  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  56.67 
 
 
344 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  57 
 
 
345 aa  340  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  51.48 
 
 
331 aa  340  2.9999999999999998e-92  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  55.52 
 
 
368 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  49.5 
 
 
333 aa  337  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  48.84 
 
 
330 aa  329  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 
381 aa  322  7e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  44.24 
 
 
329 aa  289  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  44.77 
 
 
346 aa  261  1e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  41.28 
 
 
330 aa  255  7e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  42.16 
 
 
345 aa  239  5e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  39.26 
 
 
336 aa  225  7e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  39.14 
 
 
336 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  39.23 
 
 
334 aa  206  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  38.24 
 
 
340 aa  205  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  36.58 
 
 
343 aa  205  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  37.74 
 
 
340 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
284 aa  95.9  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 
275 aa  89.4  7e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  28.57 
 
 
262 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 
267 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1459  alpha/beta hydrolase fold  25.89 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  41.73 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  31.9 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3528  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  25.51 
 
 
518 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  27.67 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.3 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  29.41 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  27.88 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
270 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  26.92 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  31.78 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  35.96 
 
 
278 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  26.92 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1100  hydrolase, alpha/beta fold family  26.92 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59036e-57 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
287 aa  80.5  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0953  alpha/beta fold family hydrolase  26.92 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1019  alpha/beta fold family hydrolase  26.92 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00544898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  26.92 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  25.67 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 
290 aa  79  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7662  alpha/beta hydrolase fold protein  37.32 
 
 
254 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.208122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  26.92 
 
 
290 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6949  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
254 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0174826 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.6 
 
 
313 aa  78.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3844  alpha/beta hydrolase fold protein  35.38 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.185404  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0705  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  26.55 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  32.14 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2147  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 
278 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 
291 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  36.79 
 
 
281 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  25.96 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  27.34 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  28.21 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
277 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 
350 aa  75.9  0.0000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>