More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2332 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
335 aa  700    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  74.23 
 
 
332 aa  528  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  73.31 
 
 
332 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  71.43 
 
 
341 aa  501  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  72.47 
 
 
332 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  69.35 
 
 
350 aa  496  1e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  69.75 
 
 
332 aa  488  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  72.4 
 
 
332 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  72.73 
 
 
332 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  64.92 
 
 
377 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  64.17 
 
 
406 aa  442  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  63.16 
 
 
387 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  62.8 
 
 
333 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  64.42 
 
 
877 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  64.61 
 
 
344 aa  434  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  64.04 
 
 
342 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  64.42 
 
 
404 aa  431  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  64.42 
 
 
439 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  64.31 
 
 
429 aa  428  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  63.9 
 
 
353 aa  429  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  64.42 
 
 
404 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  64.42 
 
 
441 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  61.59 
 
 
333 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  63.06 
 
 
353 aa  425  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  62.82 
 
 
387 aa  424  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  62.82 
 
 
353 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  62.82 
 
 
353 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  61.94 
 
 
341 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  62.5 
 
 
352 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  61.98 
 
 
352 aa  418  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  63.31 
 
 
348 aa  417  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  63.64 
 
 
339 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  61.99 
 
 
348 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  62.09 
 
 
355 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  58.23 
 
 
331 aa  396  1e-109  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  59.48 
 
 
331 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  51.35 
 
 
333 aa  351  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  48.31 
 
 
330 aa  333  4e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  53.29 
 
 
344 aa  330  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  52.96 
 
 
344 aa  329  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  48.01 
 
 
331 aa  328  7e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 
381 aa  325  8.000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  48.84 
 
 
333 aa  323  2e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  52.16 
 
 
345 aa  322  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  51.32 
 
 
368 aa  314  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  42.77 
 
 
329 aa  277  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  46.35 
 
 
346 aa  272  7e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  42.68 
 
 
330 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  38.15 
 
 
345 aa  239  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  37.85 
 
 
336 aa  223  4e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  35.5 
 
 
336 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  34.91 
 
 
340 aa  192  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  37.79 
 
 
334 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  34.6 
 
 
343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  34.74 
 
 
340 aa  189  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 
262 aa  87  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  40.77 
 
 
331 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  29.6 
 
 
313 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  29.6 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  36.15 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  36.43 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  26.12 
 
 
263 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3528  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  30.62 
 
 
518 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  37.14 
 
 
284 aa  77.8  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  37.39 
 
 
323 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  42.45 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  32.17 
 
 
306 aa  77  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  31.85 
 
 
296 aa  77  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
314 aa  76.6  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  24.56 
 
 
275 aa  76.3  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0887  alpha/beta hydrolase fold  33.07 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0583236  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  26.89 
 
 
315 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  32.35 
 
 
278 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  30.28 
 
 
323 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  26.96 
 
 
281 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  36.89 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
312 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2956  Alpha/beta hydrolase  26.01 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.419373  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0377  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 
258 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.303616  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  26.26 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  38.68 
 
 
350 aa  73.6  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2171  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.595309  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  35.92 
 
 
341 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  32.56 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  24.41 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
278 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  38.68 
 
 
298 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  26.99 
 
 
267 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  26.1 
 
 
350 aa  72  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>