More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3264 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3264  hydrolase, alpha/beta fold family  100 
 
 		 332 aa  690    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.250309  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3101  Alpha/beta hydrolase fold  91.87 
 
 		 332 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0283201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2332  alpha/beta hydrolase fold  75.88 
 
 		 335 aa  521  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0279052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1851  alpha/beta hydrolase fold  70.39 
 
 		 332 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00240679 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1824  alpha/beta hydrolase fold  72.24 
 
 		 332 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.459481  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2201  alpha/beta fold family hydrolase  74.35 
 
 		 332 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2551  Alpha/beta hydrolase fold  70.64 
 
 		 341 aa  502  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3536  alpha/beta hydrolase fold  74.03 
 
 		 332 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2147  Alpha/beta hydrolase fold  69.11 
 
 		 350 aa  489  1e-137  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  66.36 
 
 		 377 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  66.56 
 
 		 406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  67.1 
 
 		 353 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  64.26 
 
 		 342 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2862  alpha/beta fold family hydrolase  65.16 
 
 		 877 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  66.23 
 
 		 344 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  65.58 
 
 		 404 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  65.58 
 
 		 404 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  64.63 
 
 		 429 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  65.27 
 
 		 387 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  66.13 
 
 		 352 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  65.27 
 
 		 353 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  64.61 
 
 		 387 aa  441  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  65.27 
 
 		 353 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  65.58 
 
 		 441 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  65.58 
 
 		 439 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  65.27 
 
 		 353 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  65.48 
 
 		 352 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24610  putative hydrolytic enzyme  62.04 
 
 		 333 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0978  alpha/beta hydrolase fold  64.71 
 
 		 339 aa  435  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2084  putative hydrolytic enzyme  60.49 
 
 		 333 aa  431  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18880  hydrolase, alpha/beta fold family  62.26 
 
 		 341 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.481755  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1333  alpha/beta hydrolase fold protein  63.31 
 
 		 348 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59598  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1269  alpha/beta hydrolase fold  62.07 
 
 		 348 aa  421  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331641  normal  0.0800465 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1396  putative transmembrane protein  61.76 
 
 		 355 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3048  alpha/beta hydrolase fold  58.05 
 
 		 331 aa  392  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.685817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4244  alpha/beta hydrolase fold  57.45 
 
 		 331 aa  388  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0679936  hitchhiker  0.00909943 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09348  probable hydrolytic enzyme  51.64 
 
 		 331 aa  342  4e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5919  alpha/beta hydrolase fold protein  52.6 
 
 		 381 aa  342  7e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.539909 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3025  alpha/beta hydrolase fold  54.82 
 
 		 344 aa  337  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.4911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3132  alpha/beta hydrolase fold protein  54.15 
 
 		 344 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.20322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2939  Alpha/beta hydrolase  53.49 
 
 		 345 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0843  alpha/beta hydrolase fold protein  50.31 
 
 		 333 aa  334  1e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1166  alpha/beta hydrolase fold protein  50.66 
 
 		 333 aa  332  6e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1580  alpha/beta hydrolase fold  52.82 
 
 		 368 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.541417  normal  0.0105004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2626  alpha/beta hydrolase fold  47.85 
 
 		 330 aa  325  6e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0626174  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  47.72 
 
 		 329 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0611  alpha/beta hydrolase fold  46.03 
 
 		 346 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0064  alpha/beta hydrolase fold  40.88 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1320  alpha/beta hydrolase fold  39.13 
 
 		 345 aa  238  9e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.543574  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1253  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.264331  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3391  alpha/beta hydrolase fold  38.83 
 
 		 336 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445153  normal  0.48468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5020  putative alpha/beta hydrolase  39.06 
 
 		 334 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3327  alpha/beta hydrolase fold  36.31 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.445805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3130  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 343 aa  189  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0116924  normal  0.0589149 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3451  alpha/beta hydrolase fold protein  35.88 
 
 		 340 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0037  putative alpha/beta hydrolase  30.22 
 
 		 276 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1090  hydrolase, alpha/beta fold family  27.05 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1030  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 		 280 aa  82  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.999949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  36.92 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0128  alpha/beta hydrolase fold  29.67 
 
 		 262 aa  81.6  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  36.15 
 
 		 331 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  29.01 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  33.08 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  26.06 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5868  alpha/beta hydrolase fold protein  27.21 
 
 		 281 aa  76.3  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.139447 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 339 aa  76.3  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3528  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  31.74 
 
 		 518 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4112  alpha/beta hydrolase fold protein  25.94 
 
 		 278 aa  75.9  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.308124  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1308  alpha/beta fold family hydrolase  25.27 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.100773  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  40.57 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  35.85 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  35.85 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  35.85 
 
 		 284 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  35.85 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1823  alpha/beta hydrolase fold protein  34.07 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  30.37 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2335  alpha/beta hydrolase fold  25.52 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1463  Alpha/beta hydrolase  35.45 
 
 		 278 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.234917  normal  0.480235 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  27.04 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  34.78 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1136  alpha/beta hydrolase fold  24.08 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0592  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 		 288 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  24.46 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  30.3 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  35.85 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  34.82 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1059  alpha/beta hydrolase fold  25.83 
 
 		 354 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  31.33 
 
 		 291 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  35.45 
 
 		 287 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1509  alpha/beta hydrolase fold  25.47 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2052  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111851  normal  0.974564 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  34.65 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>