More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6469 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  100 
 
 		 287 aa  572  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  65.4 
 
 		 292 aa  377  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  54.67 
 
 		 296 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  53.45 
 
 		 295 aa  285  4e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  42.86 
 
 		 301 aa  199  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  46.15 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  43.96 
 
 		 300 aa  182  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  38.36 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0534  alpha/beta hydrolase fold protein  44.81 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  44.73 
 
 		 300 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  32.74 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  32.38 
 
 		 293 aa  168  7e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  32.98 
 
 		 290 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  28.06 
 
 		 302 aa  95.9  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  29.09 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  31.34 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  28.28 
 
 		 314 aa  90.1  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  48.6 
 
 		 294 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  32.3 
 
 		 302 aa  89.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  26.42 
 
 		 324 aa  89.4  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  30.52 
 
 		 282 aa  89.4  7e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  39.66 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  27.5 
 
 		 302 aa  87  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.17 
 
 		 461 aa  86.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  25.18 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  32.14 
 
 		 303 aa  85.1  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  26.33 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  39.17 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  44.76 
 
 		 289 aa  82.8  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  31.29 
 
 		 286 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  34.26 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  33.83 
 
 		 288 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  37.39 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  40.91 
 
 		 300 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  26.15 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  27.3 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  27.3 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  29.47 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  29.47 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  29.47 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  30.65 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  32.79 
 
 		 335 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  33.49 
 
 		 288 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  44.14 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  33.22 
 
 		 304 aa  79  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  33.49 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  41.28 
 
 		 289 aa  78.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  40.37 
 
 		 356 aa  78.2  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  31.18 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  41.03 
 
 		 300 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0197  alpha/beta hydrolase fold protein  24.82 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4021  alpha/beta hydrolase fold  37.1 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.655043  normal  0.26756 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4764  alpha/beta hydrolase fold  32.06 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  32.66 
 
 		 283 aa  76.6  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0521  alpha/beta hydrolase fold  28.03 
 
 		 288 aa  76.6  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  29.58 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 278 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  29.45 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  27.27 
 
 		 326 aa  76.3  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  32.68 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02319  haloalkane dehalogenase  34.23 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.5 
 
 		 639 aa  75.5  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1837  Alpha/beta hydrolase fold  41.44 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.67259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  25.95 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  30.39 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  36.13 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  35.9 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  27.18 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  34.64 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0177  alpha/beta hydrolase fold protein  37.11 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  39.32 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  31.68 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 339 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7174  alpha/beta hydrolase fold  36.7 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1796  alpha/beta hydrolase fold protein  37.29 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.883295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  37.82 
 
 		 264 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1487  alpha/beta hydrolase fold protein  37.8 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.672056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1797  alpha/beta hydrolase fold  27.7 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.696369  normal  0.363758 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 		 291 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5145  alpha/beta hydrolase fold protein  40.37 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  42.37 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3633  alpha/beta hydrolase fold  38.74 
 
 		 315 aa  72.4  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0170844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  25.77 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  36.75 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3547  alpha/beta hydrolase fold  32.02 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.409212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  38.1 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  28.47 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>