More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6597 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  100 
 
 
296 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  62.8 
 
 
292 aa  367  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  54.67 
 
 
287 aa  304  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  53.2 
 
 
295 aa  303  2.0000000000000002e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  44.91 
 
 
294 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  44.03 
 
 
300 aa  203  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  39.73 
 
 
301 aa  199  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  43.01 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  39.73 
 
 
330 aa  195  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  34.32 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  34.32 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0534  alpha/beta hydrolase fold protein  43.55 
 
 
298 aa  183  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  28.03 
 
 
314 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
290 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  34.12 
 
 
294 aa  99.4  7e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  25.75 
 
 
303 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  28.99 
 
 
286 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  29.43 
 
 
303 aa  89.7  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  27.08 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  31.55 
 
 
287 aa  87.8  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  29.41 
 
 
302 aa  87  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  33.18 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
299 aa  82  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  25.89 
 
 
306 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 
278 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  31.25 
 
 
299 aa  80.5  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  41.96 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02319  haloalkane dehalogenase  27.08 
 
 
306 aa  79.3  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
293 aa  79  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  31.61 
 
 
308 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  25.55 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  32.74 
 
 
461 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  26.07 
 
 
297 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  36.61 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  26.81 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  28.47 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
275 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  28.47 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  28.47 
 
 
304 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1079  alpha/beta hydrolase fold  30.46 
 
 
283 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.622662  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  25.89 
 
 
318 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  25.42 
 
 
301 aa  77  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  25.36 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  30.32 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  25 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
302 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  30 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  26.69 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
339 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 
861 aa  74.7  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
295 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  26.91 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  35.14 
 
 
300 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  26.88 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  28.05 
 
 
282 aa  72.4  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  40.82 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1799  Alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 
275 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 
299 aa  70.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 
289 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  36.21 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  27.24 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 
278 aa  70.5  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 
298 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 
278 aa  68.9  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  36.45 
 
 
287 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  27.64 
 
 
875 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  41.24 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  41.24 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2882  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.035123 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  38.68 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17450  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.13 
 
 
899 aa  67.4  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  24.54 
 
 
309 aa  67  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  38.89 
 
 
308 aa  67.4  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  25.27 
 
 
294 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 
344 aa  66.6  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  43.75 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  27.81 
 
 
298 aa  66.2  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13240  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.5 
 
 
978 aa  66.2  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  26.95 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  35.04 
 
 
300 aa  66.2  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4001  alpha/beta hydrolase fold protein  28.32 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  30.33 
 
 
335 aa  65.9  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02800  haloalkane dehalogenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G01700)  29.02 
 
 
485 aa  65.9  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.417921 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0369  alpha/beta hydrolase fold protein  35.34 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.598497 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  37.61 
 
 
639 aa  65.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 
289 aa  65.9  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>