More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2154 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  100 
 
 
308 aa  645    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  77.35 
 
 
290 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  76.71 
 
 
318 aa  488  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  76.37 
 
 
320 aa  488  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  76.03 
 
 
339 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  76.03 
 
 
339 aa  484  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  76.82 
 
 
295 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  75.43 
 
 
301 aa  481  1e-135  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  75.34 
 
 
302 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  75.34 
 
 
302 aa  479  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  75.34 
 
 
302 aa  478  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  73.9 
 
 
303 aa  475  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  75 
 
 
302 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  73.52 
 
 
293 aa  471  1e-132  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  74.91 
 
 
297 aa  471  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  72.35 
 
 
297 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  74.22 
 
 
291 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  62.76 
 
 
294 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  63.1 
 
 
298 aa  395  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  60.14 
 
 
296 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  62.8 
 
 
310 aa  392  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  61.89 
 
 
300 aa  381  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  62.02 
 
 
300 aa  380  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  52.96 
 
 
294 aa  322  5e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  55.16 
 
 
296 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  51.03 
 
 
300 aa  295  8e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  49.49 
 
 
301 aa  289  4e-77  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  49.49 
 
 
301 aa  288  1e-76  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  46.31 
 
 
299 aa  286  4e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 
296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  45.61 
 
 
294 aa  261  6.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  40.69 
 
 
314 aa  204  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  32.15 
 
 
304 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  32.15 
 
 
304 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  31.91 
 
 
307 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  31.46 
 
 
307 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2462  AMP-dependent synthetase and ligase  30.15 
 
 
861 aa  138  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.199446  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  31.46 
 
 
307 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  31.46 
 
 
307 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13240  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.14 
 
 
978 aa  135  7.000000000000001e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4241  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 
875 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.727325  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0447  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 
927 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07150  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.42 
 
 
922 aa  132  9e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0417779  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36600  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.8 
 
 
922 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.478291  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 
289 aa  129  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  30.8 
 
 
299 aa  125  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  30.6 
 
 
302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  27.89 
 
 
286 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  30.6 
 
 
293 aa  121  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17450  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.74 
 
 
899 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.17047  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  31.51 
 
 
302 aa  117  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
294 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  31.19 
 
 
300 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 
287 aa  112  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1681  AMP-dependent synthetase and ligase  28.1 
 
 
915 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0151795  normal  0.841697 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  28.9 
 
 
299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  29.6 
 
 
306 aa  107  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  24.92 
 
 
330 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  25.58 
 
 
300 aa  103  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
324 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  27.93 
 
 
321 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
323 aa  102  6e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  25.9 
 
 
302 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 
300 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 
329 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  26.13 
 
 
324 aa  99.8  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  27.88 
 
 
301 aa  99.8  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  38.86 
 
 
304 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  38.86 
 
 
304 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  38.86 
 
 
304 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
303 aa  99.8  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  27.8 
 
 
298 aa  99  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  27.65 
 
 
304 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  29.7 
 
 
302 aa  98.2  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  22.97 
 
 
284 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  42.24 
 
 
302 aa  96.3  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  24.04 
 
 
275 aa  95.1  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  25.42 
 
 
310 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  26.5 
 
 
301 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  26.23 
 
 
311 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  28.94 
 
 
309 aa  93.6  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  27.94 
 
 
323 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  26.4 
 
 
291 aa  93.2  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  25.74 
 
 
289 aa  92.8  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  27.72 
 
 
301 aa  92.8  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0582  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
336 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4848  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  23.94 
 
 
314 aa  92  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0862  alpha/beta hydrolase fold protein  28.68 
 
 
291 aa  91.3  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0771679  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6373  alpha/beta hydrolase fold protein  27.96 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0178  alpha/beta hydrolase  24.46 
 
 
323 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  27.74 
 
 
335 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0548  Alpha/beta hydrolase fold-1  27.3 
 
 
334 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.67 
 
 
461 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  30.43 
 
 
303 aa  90.5  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4733  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
294 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.596805  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  26.77 
 
 
282 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1031  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 
300 aa  90.1  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.733702  normal  0.157173 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  28.98 
 
 
300 aa  90.1  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
288 aa  89.7  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>