More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4334 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
278 aa  563  1.0000000000000001e-159  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  47.48 
 
 
287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  47.86 
 
 
291 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  47.14 
 
 
291 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  47.48 
 
 
291 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  47.48 
 
 
291 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  41.55 
 
 
294 aa  235  6e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  47.48 
 
 
291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  44.84 
 
 
294 aa  232  6e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  43.7 
 
 
290 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  45.39 
 
 
291 aa  229  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  43.33 
 
 
290 aa  228  6e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  46.43 
 
 
292 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  46.62 
 
 
297 aa  226  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  46.91 
 
 
291 aa  223  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  47.14 
 
 
295 aa  223  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  47.91 
 
 
290 aa  221  9e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  45.91 
 
 
293 aa  221  9e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  44.09 
 
 
300 aa  221  9e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  44.68 
 
 
291 aa  219  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  46.64 
 
 
298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  44.21 
 
 
292 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  44.98 
 
 
298 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  44.98 
 
 
298 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  44.98 
 
 
298 aa  214  9e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  44.98 
 
 
316 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  45.35 
 
 
316 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  44.98 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  44.98 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  44.09 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  44.09 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  44.09 
 
 
304 aa  212  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  44.24 
 
 
298 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  44.29 
 
 
298 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  45.2 
 
 
292 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  44.24 
 
 
323 aa  209  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  42.96 
 
 
292 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  42.75 
 
 
299 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  46.83 
 
 
294 aa  208  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  45.35 
 
 
298 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  43.01 
 
 
304 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  43.49 
 
 
296 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  45.04 
 
 
308 aa  205  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  41.49 
 
 
297 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  44.68 
 
 
308 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 
312 aa  203  3e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  42.11 
 
 
301 aa  203  3e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  45.66 
 
 
298 aa  202  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  42.28 
 
 
294 aa  201  9e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  39.44 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  45.28 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  42.75 
 
 
292 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 
299 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  42.36 
 
 
309 aa  199  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  42.91 
 
 
289 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  43.77 
 
 
303 aa  198  7e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  43.88 
 
 
301 aa  198  9e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  42.29 
 
 
308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  42.05 
 
 
301 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 
302 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  42.01 
 
 
296 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  40.99 
 
 
301 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  40.94 
 
 
292 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  41.64 
 
 
305 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  37.23 
 
 
324 aa  189  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  38.87 
 
 
297 aa  188  9e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  40.99 
 
 
295 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  41.34 
 
 
292 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  41.73 
 
 
292 aa  186  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 
290 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  40.43 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  38.52 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  38.61 
 
 
313 aa  181  9.000000000000001e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  41.91 
 
 
301 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  41.13 
 
 
294 aa  176  5e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  40.71 
 
 
306 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  40.71 
 
 
306 aa  175  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  40.65 
 
 
300 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  37.32 
 
 
317 aa  169  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  42.42 
 
 
292 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  42.28 
 
 
301 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  36.59 
 
 
321 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  37.77 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  39.08 
 
 
335 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  35.38 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  38.13 
 
 
294 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  36.56 
 
 
335 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  37.28 
 
 
282 aa  159  6e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  35.04 
 
 
302 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  38.1 
 
 
288 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  37.55 
 
 
287 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  43.96 
 
 
194 aa  157  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  38.99 
 
 
309 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  39.84 
 
 
336 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  38.58 
 
 
286 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3595  alpha/beta hydrolase fold  37.63 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  36.03 
 
 
306 aa  152  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  37.77 
 
 
321 aa  152  5e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  34.17 
 
 
309 aa  151  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>