More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4310 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 309 aa  634    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  45.85 
 
 		 321 aa  231  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  43.62 
 
 		 312 aa  221  9e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  41.84 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  39.6 
 
 		 306 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  39.6 
 
 		 306 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  41.52 
 
 		 302 aa  205  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  39.47 
 
 		 302 aa  203  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  40.93 
 
 		 306 aa  202  6e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  42.55 
 
 		 317 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  38.82 
 
 		 302 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  40.45 
 
 		 304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  40.23 
 
 		 296 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  35.88 
 
 		 340 aa  185  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  35.92 
 
 		 335 aa  185  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  35.09 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  34.86 
 
 		 348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  34.63 
 
 		 341 aa  177  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34.8 
 
 		 346 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  34.52 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 		 290 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  35.23 
 
 		 320 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  38.91 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  34.13 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  35.16 
 
 		 282 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  31.65 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  36.07 
 
 		 287 aa  156  4e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 		 351 aa  156  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  34.49 
 
 		 311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 298 aa  154  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  34.66 
 
 		 284 aa  154  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 		 291 aa  153  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  32.5 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  34.17 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0851  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 		 320 aa  149  6e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  32.62 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  32.49 
 
 		 291 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 		 278 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  31.64 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 		 291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  29.17 
 
 		 303 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 		 287 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 		 370 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  31.14 
 
 		 293 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  29.11 
 
 		 290 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  29.11 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  30.03 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  30.85 
 
 		 292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  32.64 
 
 		 290 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 291 aa  112  6e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2119  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  27.7 
 
 		 297 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  29.79 
 
 		 299 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  27.05 
 
 		 289 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  31.32 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 		 281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 		 289 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5733  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 		 288 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.74 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  28.86 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 284 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  26.03 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  29.66 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  28.28 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  29.33 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 288 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  29.63 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 		 294 aa  102  6e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  28.37 
 
 		 291 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 		 302 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  31.29 
 
 		 292 aa  102  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  30.4 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  30.4 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  28.57 
 
 		 316 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  29.35 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  30.4 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  29.68 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  39.86 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.24 
 
 		 292 aa  100  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 		 286 aa  99.4  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  28.01 
 
 		 316 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>