More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2428 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  100 
 
 
299 aa  616  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1253  haloalkane dehalogenase  56.61 
 
 
303 aa  348  6e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2056  haloalkane dehalogenase  54.05 
 
 
302 aa  339  4e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2384  haloalkane dehalogenase  53.87 
 
 
298 aa  333  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00566343 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  54.27 
 
 
302 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  53.85 
 
 
300 aa  330  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3680  haloalkane dehalogenase  52.03 
 
 
302 aa  330  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  52.54 
 
 
306 aa  328  7e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  49.67 
 
 
302 aa  301  7.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  46.67 
 
 
310 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  49.15 
 
 
303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02319  haloalkane dehalogenase  44.75 
 
 
306 aa  280  3e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4949  haloalkane dehalogenase  48 
 
 
304 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00300745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5037  haloalkane dehalogenase  48 
 
 
304 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354901  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5330  haloalkane dehalogenase  48 
 
 
304 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1777  alpha/beta hydrolase fold  40.51 
 
 
324 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0102  alpha/beta hydrolase fold protein  41.16 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1907  alpha/beta hydrolase fold protein  41.02 
 
 
299 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.05 
 
 
461 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2620  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  47.37 
 
 
482 aa  155  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4004  haloalkane dehalogenase  55.46 
 
 
118 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0342025 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2286  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.82 
 
 
363 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.382351  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  33.22 
 
 
314 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  35.33 
 
 
484 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1997  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38.49 
 
 
411 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.382734 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  29.53 
 
 
291 aa  116  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  30.6 
 
 
300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1849  Alpha/beta hydrolase  32.82 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.542461  normal  0.272584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3335  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 
307 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674591  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4184  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 
307 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4182  alpha/beta hydrolase fold  33.64 
 
 
307 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.250212  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03953  haloalkane dehalogenase  32.37 
 
 
300 aa  112  5e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  29.9 
 
 
301 aa  112  9e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3998  alpha/beta hydrolase fold protein  42.51 
 
 
304 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.901488  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3885  alpha/beta hydrolase fold  42.51 
 
 
304 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.345695  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  28.9 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0885  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  30.03 
 
 
294 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
297 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
294 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0168  alpha/beta hydrolase fold  33.05 
 
 
296 aa  109  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
299 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
296 aa  106  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4809  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.31 
 
 
475 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.779004  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 
301 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  28.77 
 
 
290 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 
296 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 
293 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  27.69 
 
 
295 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  27.99 
 
 
318 aa  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  28.2 
 
 
297 aa  100  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
339 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
339 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
320 aa  99.8  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  29.94 
 
 
330 aa  99  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 
298 aa  98.6  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
303 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  28.98 
 
 
286 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  31.02 
 
 
300 aa  96.3  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  26.95 
 
 
302 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
302 aa  95.9  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
302 aa  95.5  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  29.09 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
302 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  30.47 
 
 
301 aa  94  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  28.23 
 
 
300 aa  92.8  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
300 aa  92.8  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  32.18 
 
 
302 aa  92.8  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  32.12 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  31.14 
 
 
300 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  45.6 
 
 
361 aa  90.9  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2796  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.55 
 
 
369 aa  89.7  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  28.99 
 
 
287 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.8 
 
 
361 aa  89  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1183  alpha/beta fold family hydrolase  28.23 
 
 
310 aa  87.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  35.82 
 
 
288 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2155  alpha/beta hydrolase fold protein  27.98 
 
 
279 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2111  Haloalkane dehalogenase  27.98 
 
 
279 aa  86.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 
294 aa  85.9  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0008  haloalkane dehalogenase  26.92 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.717639  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  39.83 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1552  alpha/beta hydrolase fold protein  35.71 
 
 
329 aa  82.8  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.116512  hitchhiker  0.00140159 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  42.86 
 
 
292 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1077  alpha/beta hydrolase fold protein  38.46 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0749091  normal  0.76361 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  31.25 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 
294 aa  80.1  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  31.08 
 
 
301 aa  79.7  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2664  alpha/beta hydrolase fold protein  36.21 
 
 
321 aa  79.7  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 
288 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5038  Alpha/beta hydrolase fold  27.72 
 
 
282 aa  79  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6462  alpha/beta hydrolase fold protein  38.02 
 
 
284 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.056485  normal  0.485183 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3930  alpha/beta hydrolase fold protein  35.9 
 
 
303 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0901  haloalkane dehalogenase  28.57 
 
 
298 aa  79  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817656 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 
288 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  38.94 
 
 
293 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  34.11 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
287 aa  77.4  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1520  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 
323 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.41 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>