More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5099 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5099  haloalkane dehalogenase  100 
 
 
295 aa  588  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548735  normal  0.0388419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7956  haloalkane dehalogenase  55.86 
 
 
292 aa  313  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6597  haloalkane dehalogenase  53.2 
 
 
296 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000200949 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6469  haloalkane dehalogenase  53.45 
 
 
287 aa  285  5e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.805806  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7423  alpha/beta hydrolase fold protein  45.49 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.524184 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0257  alpha/beta hydrolase fold protein  46.04 
 
 
300 aa  209  5e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2620  haloalkane dehalogenase  43.75 
 
 
330 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.198111  normal  0.243328 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1611  haloalkane dehalogenase  39.79 
 
 
301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1370  haloalkane dehalogenase  36.99 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  6.59212e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1310  haloalkane dehalogenase  36.99 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000017212  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0534  alpha/beta hydrolase fold protein  40.48 
 
 
298 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12599  haloalkane dehalogenase  39.38 
 
 
300 aa  176  6e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.365341  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 
290 aa  99.4  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  29.67 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0552  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 
294 aa  90.1  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1366  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
291 aa  89.4  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2735  alpha/beta hydrolase fold  26.35 
 
 
301 aa  89  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.211844  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11862  haloalkane dehalogenase  26.97 
 
 
286 aa  89  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.608613 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2625  alpha/beta hydrolase  30.35 
 
 
314 aa  86.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.981028  normal  0.155389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 
275 aa  87  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1551  alpha/beta hydrolase fold  26.51 
 
 
302 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2200  alpha/beta hydrolase fold protein  41.38 
 
 
278 aa  85.1  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  29.58 
 
 
335 aa  85.1  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  38.53 
 
 
291 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2154  alpha/beta fold family hydrolase  26.83 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0592253  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1547  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
287 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2009  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2671  haloalkane dehalogenase  29.58 
 
 
302 aa  83.2  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.731283  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1511  alpha/beta hydrolase fold  31.53 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2799  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1370  alpha/beta hydrolase fold  26.64 
 
 
297 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1446  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.947535  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.02 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1581  alpha/beta hydrolase fold  26.17 
 
 
302 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.217247  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1743  alpha/beta fold family hydrolase  26.92 
 
 
318 aa  82  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2475  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 
287 aa  81.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3277  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 
296 aa  81.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.38923  normal  0.207617 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2638  alpha/beta hydrolase fold protein  31.4 
 
 
294 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2009  alpha/beta hydrolase fold  28.17 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1714  alpha/beta hydrolase fold  25.67 
 
 
290 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6705  alpha/beta hydrolase fold protein  32.77 
 
 
335 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3104  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7101  alpha/beta hydrolase fold protein  41.03 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.974573 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3526  alpha/beta hydrolase fold  26.88 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2714  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2762  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2547  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 
339 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2614  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 
339 aa  79  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  35.78 
 
 
290 aa  79.3  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3158  alpha/beta hydrolase fold  31.03 
 
 
297 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1998  alpha/beta hydrolase fold  36.04 
 
 
293 aa  78.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.918963  normal  0.449099 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2117  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
300 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  30 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3197  haloalkane dehalogenase  28.22 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0300138 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1915  haloalkane dehalogenase  26.86 
 
 
306 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2446  alpha/beta hydrolase fold protein  36.59 
 
 
309 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.969901  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0828  alpha/beta fold family hydrolase  34.45 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3993  alpha/beta hydrolase fold protein  23.86 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2447  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  33.01 
 
 
461 aa  76.3  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4035  alpha/beta hydrolase fold protein  23.86 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.688921  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  27.53 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  39.44 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1391  putative hydrolase  44.23 
 
 
387 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2270  alpha/beta hydrolase fold  26.15 
 
 
298 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12319  haloalkane dehalogenase  30.73 
 
 
300 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0266  alpha/beta hydrolase fold protein  32.21 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2428  haloalkane dehalogenase  41.58 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  25.68 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2899  alpha/beta hydrolase fold protein  39.34 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2101  alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.933589  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  30.14 
 
 
301 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 
295 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0136  alpha/beta hydrolase fold protein  37.07 
 
 
289 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.732439  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  25.44 
 
 
290 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  24.16 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  37.11 
 
 
268 aa  73.6  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01260  haloalkane dehalogenase  27.66 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.754797  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0955  alpha/beta hydrolase fold  37.98 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1007  haloalkane dehalogenase  26.98 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0490132  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  34.86 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  34.86 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  34.86 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  40.21 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  40.21 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5957  alpha/beta hydrolase fold  38.46 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0650876 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  40.21 
 
 
291 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3409  putative alpha/beta hydrolase  32.58 
 
 
409 aa  72.8  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.620958  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0108  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  35.77 
 
 
639 aa  72.4  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0547  twin-arginine translocation pathway signal  36.79 
 
 
356 aa  72.4  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3721  Alpha/beta hydrolase  26.51 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.305299  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3743  Alpha/beta hydrolase  34.45 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0220967  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6821  alpha/beta hydrolase fold protein  30.72 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  34.45 
 
 
321 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  42.31 
 
 
387 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  27.54 
 
 
351 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>