More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1800 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 351 aa  715    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  58.21 
 
 		 346 aa  390  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35.4 
 
 		 341 aa  180  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  37.81 
 
 		 335 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  33.63 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 		 348 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  39.34 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  35.69 
 
 		 309 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  33.69 
 
 		 321 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 		 306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  31.05 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  38.11 
 
 		 278 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  34.59 
 
 		 294 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  34.14 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  33.59 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  35.47 
 
 		 296 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  35.36 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 		 302 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  34.75 
 
 		 283 aa  141  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  34.54 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  34.85 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  33.46 
 
 		 306 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  34.47 
 
 		 302 aa  136  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  34.1 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  34.23 
 
 		 262 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  30.19 
 
 		 291 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  32.14 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 		 284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  34.98 
 
 		 292 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 		 309 aa  122  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  31.54 
 
 		 281 aa  119  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0851  alpha/beta hydrolase fold  32.82 
 
 		 320 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  32.98 
 
 		 309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  34.89 
 
 		 304 aa  115  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 		 300 aa  115  7.999999999999999e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  34.89 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  34.89 
 
 		 304 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  32.3 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 		 295 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  29.7 
 
 		 319 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 		 291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  32.07 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  31.69 
 
 		 302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 288 aa  110  5e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  30.14 
 
 		 291 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  32.03 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 		 291 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  29.54 
 
 		 287 aa  106  7e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 301 aa  106  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 		 291 aa  106  7e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 292 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  30.86 
 
 		 298 aa  104  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  27.6 
 
 		 370 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  30.8 
 
 		 301 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 278 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 		 289 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  31.11 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  31.41 
 
 		 294 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  26.37 
 
 		 289 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  31.52 
 
 		 297 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  29.27 
 
 		 297 aa  100  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  32.01 
 
 		 292 aa  99.4  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  31.01 
 
 		 292 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  29.28 
 
 		 290 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  32.84 
 
 		 292 aa  99  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  31.84 
 
 		 290 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  32.21 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  33.71 
 
 		 289 aa  98.6  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  30.08 
 
 		 294 aa  98.6  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  28.33 
 
 		 313 aa  97.4  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 291 aa  97.8  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  31.18 
 
 		 301 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  32.4 
 
 		 295 aa  96.7  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5733  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 288 aa  96.7  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 		 292 aa  96.3  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 		 290 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1047  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 		 275 aa  95.1  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  30.24 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  30.42 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  25.27 
 
 		 290 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  28.25 
 
 		 294 aa  94.4  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  32.96 
 
 		 305 aa  93.6  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  29.11 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>