More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4400 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
306 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
306 aa  623  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  42.61 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  42.2 
 
 
282 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  39.6 
 
 
309 aa  205  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  41.43 
 
 
321 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  41.72 
 
 
335 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  40.57 
 
 
294 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  45.04 
 
 
292 aa  198  7e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  39.3 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  39.3 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  39.3 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  39.01 
 
 
320 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  41.81 
 
 
290 aa  193  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 
297 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  38.3 
 
 
298 aa  187  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  40.51 
 
 
312 aa  186  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  37.79 
 
 
262 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  40.27 
 
 
335 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  36.55 
 
 
298 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  38.95 
 
 
346 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
324 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  40.71 
 
 
278 aa  175  7e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  37.42 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  37.71 
 
 
340 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  37.2 
 
 
348 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  37.46 
 
 
302 aa  166  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  38.6 
 
 
302 aa  165  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  40.21 
 
 
309 aa  165  8e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.73 
 
 
341 aa  165  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  35.21 
 
 
284 aa  165  9e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  37.33 
 
 
296 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  36.9 
 
 
304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  36.99 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  37.28 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  35.31 
 
 
291 aa  163  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  36.65 
 
 
302 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  35.21 
 
 
317 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  36.79 
 
 
287 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  36.77 
 
 
311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  35.69 
 
 
291 aa  155  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  33.93 
 
 
302 aa  155  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  37.55 
 
 
291 aa  155  8e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  37.18 
 
 
291 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  34.97 
 
 
351 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  37.32 
 
 
291 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  33.56 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 
291 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 
291 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  30.21 
 
 
303 aa  142  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 
315 aa  136  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 
287 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  31 
 
 
301 aa  134  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  34.02 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  29.33 
 
 
289 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  28.98 
 
 
289 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  35.59 
 
 
289 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 
290 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0851  alpha/beta hydrolase fold  34.6 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 
291 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  32.96 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  29.66 
 
 
284 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2119  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  32.32 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3926  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.838043  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  32.32 
 
 
311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  32.32 
 
 
311 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  32.32 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  32.32 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  32.32 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  32.32 
 
 
296 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  31.71 
 
 
288 aa  116  3.9999999999999997e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  32.27 
 
 
287 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
294 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  30.69 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3092  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 
309 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 
291 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
287 aa  114  3e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 
308 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 
288 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  34.84 
 
 
295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  31.94 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  33 
 
 
302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  32.28 
 
 
291 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  30.77 
 
 
293 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  30.07 
 
 
291 aa  110  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  30.9 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  26.44 
 
 
370 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  29.07 
 
 
287 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  44.96 
 
 
307 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  31 
 
 
349 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  32.75 
 
 
270 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 
293 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 
324 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  27.03 
 
 
307 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5733  alpha/beta hydrolase fold protein  32.16 
 
 
288 aa  105  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  31.29 
 
 
278 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>