More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1047 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1047  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
275 aa  553  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  33.21 
 
 
291 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2473  alpha/beta hydrolase fold protein  32.95 
 
 
324 aa  144  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0409911  normal  0.0604811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  30.43 
 
 
300 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  35.53 
 
 
294 aa  141  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  32.97 
 
 
287 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  33.46 
 
 
278 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  25.45 
 
 
287 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  34.06 
 
 
335 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  34.05 
 
 
290 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
301 aa  105  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 
282 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 
306 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 
306 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  25.45 
 
 
289 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 
288 aa  102  7e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  25.09 
 
 
289 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  29.2 
 
 
301 aa  100  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 
324 aa  101  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.15 
 
 
346 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  29.71 
 
 
303 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  43.64 
 
 
287 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  31.56 
 
 
295 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
291 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 
299 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  29.29 
 
 
283 aa  96.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4764  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
300 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  29.12 
 
 
351 aa  96.3  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
278 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  31.18 
 
 
308 aa  95.5  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  30.58 
 
 
307 aa  94.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  44.55 
 
 
349 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 
291 aa  94.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  33.49 
 
 
278 aa  93.2  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  27.47 
 
 
286 aa  92.8  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 
304 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  47.12 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  47.12 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  47.12 
 
 
291 aa  92.4  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  43.64 
 
 
308 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  32.03 
 
 
294 aa  91.3  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  30.18 
 
 
309 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  28 
 
 
308 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  46.15 
 
 
291 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  28.15 
 
 
321 aa  89.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 
283 aa  89.7  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  30.56 
 
 
270 aa  89.4  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  34.57 
 
 
291 aa  89  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  24.72 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  29.21 
 
 
317 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  27.07 
 
 
313 aa  87.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 
299 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 
311 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  24.65 
 
 
290 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  29 
 
 
294 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
294 aa  87  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  30.69 
 
 
304 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  30.69 
 
 
304 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  30.69 
 
 
304 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  40.91 
 
 
310 aa  86.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
292 aa  85.9  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  29.82 
 
 
310 aa  85.9  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  32.64 
 
 
299 aa  85.5  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  27.31 
 
 
305 aa  85.5  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.3 
 
 
313 aa  85.5  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 
297 aa  85.5  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  31.03 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  30.77 
 
 
312 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  43.4 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  42.73 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  41.51 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  33.85 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1042  alpha/beta hydrolase fold  38.32 
 
 
265 aa  82.8  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  28.1 
 
 
297 aa  82.8  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  27.5 
 
 
335 aa  82.4  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 
304 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  41.96 
 
 
323 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 
308 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  33.8 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  27.82 
 
 
340 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
308 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5333  protein of unknown function DUF309  29.63 
 
 
494 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0481251 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  26.6 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  24.91 
 
 
293 aa  80.1  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  34.96 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  30.87 
 
 
288 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  27.78 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  30.22 
 
 
284 aa  80.1  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.39 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205853 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>