More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2473 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2473  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 		 324 aa  659    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0409911  normal  0.0604811 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10135  epoxide hydrolase ephF  33.33 
 
 		 300 aa  160  4e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.890635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  33.57 
 
 		 291 aa  153  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1047  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  32.85 
 
 		 294 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  30.49 
 
 		 328 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  26.96 
 
 		 303 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 		 291 aa  115  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  30.4 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  30.36 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 		 288 aa  103  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  31.67 
 
 		 286 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 288 aa  102  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.49 
 
 		 291 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 		 288 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 291 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 		 335 aa  97.1  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  34.27 
 
 		 289 aa  97.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  26.94 
 
 		 287 aa  97.4  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  29.68 
 
 		 301 aa  97.1  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 		 284 aa  96.3  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 		 309 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  31.56 
 
 		 270 aa  94.7  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  28.88 
 
 		 283 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  31.6 
 
 		 291 aa  92  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  29.72 
 
 		 308 aa  91.3  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  29.19 
 
 		 283 aa  90.9  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  24.33 
 
 		 287 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 288 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  28.86 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0132  putative hydrolase  28.72 
 
 		 311 aa  87.4  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.282626  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1448  alpha/beta hydrolase fold  33.54 
 
 		 294 aa  87  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.358742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 		 294 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  28.81 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  35.06 
 
 		 294 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 284 aa  86.3  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  24.46 
 
 		 290 aa  85.9  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  21.32 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  21.32 
 
 		 289 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  24.33 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4764  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  27.31 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  31.74 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1845  alpha/beta hydrolase fold  24.83 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.12367 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  43.97 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  28.91 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1960  alpha/beta hydrolase fold  27.08 
 
 		 278 aa  82  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.877716  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  39.73 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  39.73 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  39.73 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  44.83 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  30.87 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  27.14 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1416  Alpha/beta hydrolase fold  24.41 
 
 		 306 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.75275  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 289 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  38.26 
 
 		 317 aa  80.5  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  28.72 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  23.55 
 
 		 311 aa  80.9  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  24.82 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  24 
 
 		 308 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  49.41 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 308 aa  79.3  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 		 292 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 		 305 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  28.11 
 
 		 278 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  23.45 
 
 		 311 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  29.83 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  21.38 
 
 		 291 aa  77.8  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  47.13 
 
 		 295 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1483  alpha/beta hydrolase fold  25.28 
 
 		 275 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.768044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  22.7 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0095  alpha/beta hydrolase fold  28 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000119942  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47210  alpha/beta fold hydrolase  33.57 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0555  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 308 aa  76.3  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  22.86 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  27.53 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  27.73 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  26.49 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  29.94 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  26.91 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  29.87 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  36.52 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  36.59 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  26.91 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  29.9 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1895  alpha/beta hydrolase fold  33.87 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 		 265 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>