More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0165 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
299 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  79.53 
 
 
299 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  75.52 
 
 
308 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  74.14 
 
 
308 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  74.14 
 
 
308 aa  437  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  66.09 
 
 
298 aa  401  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  67.13 
 
 
298 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  66.44 
 
 
298 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  66.44 
 
 
298 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  63.64 
 
 
316 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  63.64 
 
 
316 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  64.95 
 
 
297 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  64.95 
 
 
297 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  64.71 
 
 
296 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  65.64 
 
 
298 aa  389  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  64.6 
 
 
323 aa  389  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  64.26 
 
 
296 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  66.08 
 
 
298 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  66.08 
 
 
298 aa  385  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  59.93 
 
 
293 aa  364  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  59.66 
 
 
292 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  58.62 
 
 
292 aa  354  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  59.18 
 
 
304 aa  349  3e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  58.11 
 
 
312 aa  345  8e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  56.55 
 
 
291 aa  344  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  58.42 
 
 
300 aa  342  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  52.76 
 
 
290 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  52.41 
 
 
290 aa  342  5e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  56.16 
 
 
297 aa  333  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  58.97 
 
 
290 aa  332  6e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  57.68 
 
 
292 aa  329  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  54.14 
 
 
297 aa  312  4.999999999999999e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  53.24 
 
 
298 aa  305  6e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  57.56 
 
 
292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  55.29 
 
 
301 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  55.14 
 
 
291 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  55.52 
 
 
303 aa  296  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  51.72 
 
 
291 aa  293  2e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  49.66 
 
 
294 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  50.34 
 
 
298 aa  288  7e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  50.84 
 
 
309 aa  287  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  53.38 
 
 
295 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  44.25 
 
 
294 aa  276  4e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  46.26 
 
 
301 aa  271  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  46.26 
 
 
301 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  48.64 
 
 
301 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  44.56 
 
 
302 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  49.45 
 
 
304 aa  261  6.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  49.08 
 
 
304 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  49.08 
 
 
304 aa  261  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  46.58 
 
 
297 aa  259  3e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  47.71 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  50.17 
 
 
294 aa  258  8e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  46.62 
 
 
303 aa  255  8e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  47.39 
 
 
300 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  44.68 
 
 
313 aa  231  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  54.97 
 
 
194 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  41.78 
 
 
295 aa  223  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  42.96 
 
 
321 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  41.72 
 
 
294 aa  222  7e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  45.97 
 
 
301 aa  218  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  41.58 
 
 
286 aa  211  9e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  45.16 
 
 
292 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  42.76 
 
 
305 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  42.75 
 
 
278 aa  209  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  42.31 
 
 
292 aa  208  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3595  alpha/beta hydrolase fold  40.69 
 
 
311 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 
294 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  43.43 
 
 
301 aa  206  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  40.41 
 
 
292 aa  205  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  38.49 
 
 
287 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  40.34 
 
 
336 aa  204  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  45.36 
 
 
288 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  38.55 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  38.38 
 
 
288 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  43.38 
 
 
309 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  44.63 
 
 
305 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  44.3 
 
 
305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  36.99 
 
 
289 aa  182  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  40.46 
 
 
292 aa  177  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  38.81 
 
 
292 aa  176  6e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  50.57 
 
 
236 aa  175  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  36.5 
 
 
287 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  37.23 
 
 
291 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  36.5 
 
 
291 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  36.5 
 
 
291 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 
291 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.77 
 
 
291 aa  155  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  36.43 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 
283 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34.01 
 
 
346 aa  128  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  31.62 
 
 
335 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  34.58 
 
 
290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  35.12 
 
 
284 aa  116  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  32.07 
 
 
351 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  30.22 
 
 
262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 
309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  28.19 
 
 
291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 
309 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  30.41 
 
 
309 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>