More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3012 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
298 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  98.66 
 
 
298 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  94.3 
 
 
298 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  94.3 
 
 
298 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  93.96 
 
 
298 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  91.25 
 
 
298 aa  563  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  94.63 
 
 
298 aa  557  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  86.87 
 
 
316 aa  542  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  87.21 
 
 
316 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  86.87 
 
 
297 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  86.87 
 
 
297 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  78.84 
 
 
296 aa  484  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  77.47 
 
 
323 aa  474  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  76.11 
 
 
296 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  66.44 
 
 
299 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  66.78 
 
 
308 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  66.78 
 
 
308 aa  384  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  67.47 
 
 
308 aa  382  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  63.57 
 
 
292 aa  383  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  63.23 
 
 
293 aa  374  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  65.98 
 
 
304 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  63.92 
 
 
299 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  62.28 
 
 
291 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  63.6 
 
 
300 aa  360  2e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  61.38 
 
 
292 aa  355  3.9999999999999996e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  57.73 
 
 
292 aa  348  6e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  65.48 
 
 
290 aa  334  9e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  57.73 
 
 
297 aa  328  8e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  52.25 
 
 
290 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  52.7 
 
 
312 aa  325  5e-88  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  51.9 
 
 
290 aa  323  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  60 
 
 
292 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  57.09 
 
 
303 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  52.94 
 
 
291 aa  303  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  53.58 
 
 
301 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  53.98 
 
 
291 aa  302  5.000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  52.17 
 
 
309 aa  301  8.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  56.51 
 
 
298 aa  297  2e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  52.8 
 
 
297 aa  295  9e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  47.75 
 
 
294 aa  292  5e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  49.83 
 
 
294 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  51.21 
 
 
295 aa  285  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  47.44 
 
 
302 aa  282  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  49.14 
 
 
301 aa  279  4e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  49.14 
 
 
298 aa  279  4e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  47.42 
 
 
301 aa  278  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  46.76 
 
 
301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  48.35 
 
 
303 aa  268  7e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  53.93 
 
 
294 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  49.07 
 
 
304 aa  259  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  48.7 
 
 
304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  48.7 
 
 
304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  47.08 
 
 
297 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  50.36 
 
 
317 aa  252  6e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  43.77 
 
 
313 aa  231  1e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  43.64 
 
 
295 aa  229  4e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  45.15 
 
 
300 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  43.05 
 
 
336 aa  223  3e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  44.18 
 
 
321 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  56.32 
 
 
194 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  42.03 
 
 
294 aa  219  5e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  46.28 
 
 
301 aa  216  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  44.98 
 
 
278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  44.93 
 
 
301 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  46.49 
 
 
294 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  40.34 
 
 
287 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  45.29 
 
 
288 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3595  alpha/beta hydrolase fold  41.55 
 
 
311 aa  198  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  41.73 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  37.5 
 
 
287 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  44.15 
 
 
292 aa  192  4e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  42.15 
 
 
292 aa  192  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  40.68 
 
 
288 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  38.85 
 
 
305 aa  188  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  41.58 
 
 
309 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  41.29 
 
 
292 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  42.47 
 
 
305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  41.81 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  52.6 
 
 
236 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  37.97 
 
 
289 aa  175  7e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  41.39 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  40.22 
 
 
292 aa  169  4e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  37.87 
 
 
287 aa  166  4e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 
291 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 
291 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  36.86 
 
 
291 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  37.26 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  37.26 
 
 
291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  33.78 
 
 
283 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  38.77 
 
 
290 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 
282 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  36.33 
 
 
292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
324 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  36.73 
 
 
294 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  36.14 
 
 
297 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.54 
 
 
346 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  29.32 
 
 
262 aa  108  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  28.22 
 
 
302 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 
287 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  32.44 
 
 
320 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>