More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3922 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
291 aa  592  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  78.02 
 
 
290 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  69.76 
 
 
292 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  70.14 
 
 
300 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  61.17 
 
 
292 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  66.19 
 
 
304 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  62.67 
 
 
292 aa  361  6e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  61.25 
 
 
298 aa  360  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  60.55 
 
 
298 aa  360  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  60.9 
 
 
298 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  60.9 
 
 
298 aa  359  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  61.09 
 
 
293 aa  355  3.9999999999999996e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  62.59 
 
 
298 aa  353  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  62.59 
 
 
298 aa  353  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  58.48 
 
 
316 aa  351  7e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  58.13 
 
 
296 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  58.48 
 
 
297 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  58.48 
 
 
297 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  58.82 
 
 
316 aa  348  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  59.66 
 
 
308 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  58.48 
 
 
323 aa  346  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  60.55 
 
 
298 aa  345  3e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  59.17 
 
 
296 aa  346  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  56.55 
 
 
299 aa  344  1e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  58.76 
 
 
308 aa  335  7e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  58.03 
 
 
308 aa  331  8e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  61.71 
 
 
292 aa  331  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  57.04 
 
 
299 aa  323  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  56.51 
 
 
297 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  58.18 
 
 
303 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  51.2 
 
 
290 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  51.2 
 
 
290 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  53.45 
 
 
294 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  51.36 
 
 
312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  53.66 
 
 
295 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  53.45 
 
 
291 aa  301  1e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  52.07 
 
 
291 aa  295  6e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  53.24 
 
 
297 aa  292  4e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  50.85 
 
 
301 aa  290  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  48.25 
 
 
294 aa  285  8e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  51.57 
 
 
309 aa  285  8e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  49.31 
 
 
304 aa  282  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  49.31 
 
 
304 aa  282  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  49.31 
 
 
304 aa  281  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  55.4 
 
 
294 aa  278  7e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  50 
 
 
298 aa  275  7e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  47.96 
 
 
303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  47.6 
 
 
298 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  45.67 
 
 
302 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  43.49 
 
 
301 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  44.77 
 
 
317 aa  249  5e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  45.55 
 
 
301 aa  248  6e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  42.12 
 
 
301 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  43 
 
 
295 aa  230  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  44.52 
 
 
297 aa  229  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  44.48 
 
 
300 aa  226  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  43.9 
 
 
294 aa  224  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  44.68 
 
 
278 aa  219  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  56.99 
 
 
194 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  43 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  41.4 
 
 
294 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  39.31 
 
 
287 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  39.03 
 
 
313 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  45.76 
 
 
301 aa  200  3e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  43.27 
 
 
288 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  38.64 
 
 
287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  46.35 
 
 
301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  40.58 
 
 
286 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3595  alpha/beta hydrolase fold  40.61 
 
 
311 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  42.39 
 
 
309 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  40.78 
 
 
292 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  37.63 
 
 
336 aa  185  7e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  37.64 
 
 
292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  39.29 
 
 
292 aa  182  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  37.72 
 
 
292 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  39.36 
 
 
287 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  36.95 
 
 
288 aa  179  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  38.65 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  38.65 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  41.61 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  39.01 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  41.24 
 
 
305 aa  172  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 
291 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  37.72 
 
 
291 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  36.65 
 
 
292 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  36.68 
 
 
305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  36.75 
 
 
289 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  48.28 
 
 
236 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  37.06 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  34.38 
 
 
282 aa  126  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 
283 aa  126  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
324 aa  123  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  33.56 
 
 
321 aa  122  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  29.02 
 
 
287 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  32.19 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  33.99 
 
 
335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  30.24 
 
 
303 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  30.27 
 
 
335 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 
290 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  31.8 
 
 
351 aa  106  4e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>