More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_0105 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
308 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  98.05 
 
 
308 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  86.32 
 
 
308 aa  529  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  73.81 
 
 
299 aa  457  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  74.37 
 
 
299 aa  431  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  66.78 
 
 
316 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  66.44 
 
 
298 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  66.44 
 
 
298 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  65.4 
 
 
316 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  66.44 
 
 
298 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  66.44 
 
 
298 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  65.4 
 
 
297 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  65.4 
 
 
297 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  64.36 
 
 
296 aa  393  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  66.78 
 
 
298 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  64.58 
 
 
293 aa  391  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  67.02 
 
 
298 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  66.67 
 
 
298 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  63.14 
 
 
323 aa  386  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  63.32 
 
 
296 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  61.38 
 
 
292 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  60.21 
 
 
300 aa  352  5.9999999999999994e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  57.63 
 
 
312 aa  351  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  58.95 
 
 
291 aa  347  1e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  59.93 
 
 
304 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  56.61 
 
 
297 aa  344  1e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  61.71 
 
 
292 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  54.14 
 
 
292 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  58.97 
 
 
290 aa  332  5e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  51.03 
 
 
290 aa  325  6e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  51.03 
 
 
290 aa  324  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  58.7 
 
 
303 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  54.64 
 
 
291 aa  316  3e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  56.66 
 
 
291 aa  313  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  59.48 
 
 
292 aa  311  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  52.53 
 
 
297 aa  306  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  51.88 
 
 
294 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  50.67 
 
 
309 aa  300  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  52.86 
 
 
301 aa  300  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  52.86 
 
 
298 aa  295  7e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  47.31 
 
 
294 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  48.47 
 
 
298 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  50.17 
 
 
295 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  47.69 
 
 
304 aa  269  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  47.33 
 
 
304 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  47.33 
 
 
304 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  45.24 
 
 
301 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  45.24 
 
 
301 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  51.55 
 
 
294 aa  264  1e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  48.46 
 
 
301 aa  263  4e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  44.41 
 
 
302 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  47.57 
 
 
303 aa  260  2e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  46.91 
 
 
317 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  45.92 
 
 
297 aa  249  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  45.89 
 
 
321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  44.33 
 
 
300 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  42.47 
 
 
295 aa  226  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  44.67 
 
 
292 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  44.68 
 
 
278 aa  221  9e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  42.96 
 
 
292 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  42.61 
 
 
305 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  44.41 
 
 
294 aa  215  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  53.4 
 
 
194 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  40.97 
 
 
313 aa  210  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  40.89 
 
 
294 aa  209  5e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3595  alpha/beta hydrolase fold  40.27 
 
 
311 aa  206  4e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 
287 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  45.82 
 
 
288 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  40.7 
 
 
292 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  44.53 
 
 
286 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  41.16 
 
 
292 aa  200  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  43.88 
 
 
301 aa  200  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  37.97 
 
 
336 aa  199  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  40.6 
 
 
301 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  41.3 
 
 
288 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  38.97 
 
 
287 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  38.7 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  41.39 
 
 
309 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  38.14 
 
 
292 aa  179  7e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  41.14 
 
 
305 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  40.13 
 
 
305 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  49.71 
 
 
236 aa  170  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 
287 aa  159  8e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  37 
 
 
291 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 
291 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 
291 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  35.9 
 
 
291 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  35.31 
 
 
291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  32.07 
 
 
283 aa  133  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  33.11 
 
 
346 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  34.63 
 
 
282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  34.28 
 
 
290 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  30.72 
 
 
306 aa  119  6e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  32.17 
 
 
321 aa  106  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 
309 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 
309 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  29.11 
 
 
309 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  27.21 
 
 
287 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 
284 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>