More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1631 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
292 aa  594  1e-169  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  82.88 
 
 
292 aa  500  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  73.01 
 
 
304 aa  425  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  58.76 
 
 
292 aa  346  3e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  61.71 
 
 
291 aa  345  7e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  59.66 
 
 
298 aa  340  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  59.31 
 
 
298 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  59.31 
 
 
298 aa  338  8e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  62.83 
 
 
300 aa  338  9e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  58.28 
 
 
296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  57.93 
 
 
316 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  56.9 
 
 
316 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  56.9 
 
 
297 aa  334  9e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  56.9 
 
 
297 aa  334  9e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  61.03 
 
 
298 aa  332  5e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  56.21 
 
 
323 aa  328  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  60.14 
 
 
298 aa  328  8e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  58.62 
 
 
298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  59.34 
 
 
290 aa  326  3e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  59.79 
 
 
298 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  54.27 
 
 
293 aa  324  1e-87  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  53.77 
 
 
292 aa  322  5e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  57.56 
 
 
299 aa  321  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  54.83 
 
 
296 aa  318  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  60.87 
 
 
308 aa  317  1e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  60.74 
 
 
308 aa  315  6e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  60.47 
 
 
308 aa  314  9e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  58.09 
 
 
299 aa  314  9e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  47.42 
 
 
290 aa  298  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  47.08 
 
 
290 aa  297  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  52.41 
 
 
291 aa  287  2e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  51.84 
 
 
312 aa  285  5e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  51.88 
 
 
297 aa  285  8e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  51.38 
 
 
297 aa  280  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  54.65 
 
 
295 aa  279  4e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  46.23 
 
 
294 aa  277  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  52.99 
 
 
294 aa  276  3e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  50.34 
 
 
291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  48.01 
 
 
304 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  48.01 
 
 
304 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  48.01 
 
 
304 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  46.94 
 
 
298 aa  262  4e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 
303 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  47.8 
 
 
301 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  52.33 
 
 
298 aa  252  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  48.68 
 
 
303 aa  248  6e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  51.88 
 
 
309 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  48.03 
 
 
294 aa  236  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  44.52 
 
 
301 aa  230  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  44.18 
 
 
297 aa  228  6e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  41.5 
 
 
301 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  40.96 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  45.26 
 
 
317 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  45.52 
 
 
295 aa  211  1e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  39.93 
 
 
301 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  53.4 
 
 
194 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  41.52 
 
 
294 aa  202  4e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  40.94 
 
 
278 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  44.78 
 
 
301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  41.24 
 
 
300 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3595  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 
311 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  43.14 
 
 
301 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  40.71 
 
 
286 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  40.81 
 
 
321 aa  182  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  43.45 
 
 
292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  38.78 
 
 
288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  40.26 
 
 
309 aa  178  7e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  41.52 
 
 
292 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  37.72 
 
 
313 aa  175  8e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  41.82 
 
 
288 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  40.96 
 
 
292 aa  171  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  41.11 
 
 
289 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  35.62 
 
 
287 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  40.88 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  40.6 
 
 
305 aa  166  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  40.27 
 
 
305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  39.85 
 
 
294 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
287 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  38.58 
 
 
292 aa  158  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  39.62 
 
 
292 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  36.69 
 
 
291 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 
287 aa  152  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  36.69 
 
 
291 aa  152  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  43.68 
 
 
236 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  36.23 
 
 
291 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  35.87 
 
 
291 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  35.87 
 
 
291 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  34.01 
 
 
282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  34.04 
 
 
290 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.34 
 
 
346 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  28.89 
 
 
262 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  30.07 
 
 
324 aa  98.6  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  31.07 
 
 
351 aa  96.7  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  27.01 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
335 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  31.49 
 
 
340 aa  92  9e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
297 aa  90.5  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  26.33 
 
 
303 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>