More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3868 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
305 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  99.34 
 
 
305 aa  597  1e-170  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  89.64 
 
 
309 aa  545  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  68.12 
 
 
301 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  67.79 
 
 
301 aa  375  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  50.17 
 
 
302 aa  279  4e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  50.82 
 
 
301 aa  277  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  49.67 
 
 
301 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  50.33 
 
 
297 aa  275  5e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  48.84 
 
 
301 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  41.64 
 
 
313 aa  224  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  39.93 
 
 
290 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  39.6 
 
 
290 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  44.63 
 
 
299 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  45.36 
 
 
298 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  42.14 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  42.14 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  42.14 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  43.64 
 
 
294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  41.81 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  41.61 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  39.93 
 
 
301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  42.47 
 
 
297 aa  196  5.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  41.53 
 
 
298 aa  196  6e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  40.8 
 
 
291 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  40.92 
 
 
309 aa  193  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  44.57 
 
 
294 aa  192  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  43.29 
 
 
308 aa  192  5e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  41.14 
 
 
298 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  41.14 
 
 
298 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  41.14 
 
 
298 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  45.2 
 
 
299 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  40.13 
 
 
296 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  42.55 
 
 
300 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  41.61 
 
 
291 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  38.69 
 
 
294 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  41.33 
 
 
296 aa  187  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  40.13 
 
 
323 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  44.07 
 
 
295 aa  185  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  41.06 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  39.27 
 
 
312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  41.97 
 
 
291 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  41.14 
 
 
298 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  40 
 
 
292 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  41.12 
 
 
297 aa  180  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  41.18 
 
 
295 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  42.31 
 
 
298 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  41.14 
 
 
308 aa  178  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  42.31 
 
 
298 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  41.14 
 
 
308 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  40.07 
 
 
336 aa  175  8e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  37.8 
 
 
303 aa  175  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  41.18 
 
 
300 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  40.28 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  40.27 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  42.75 
 
 
290 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  40.13 
 
 
304 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  43.12 
 
 
292 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  42.24 
 
 
298 aa  172  7.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  38.91 
 
 
304 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  40.27 
 
 
292 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  38.55 
 
 
304 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  38.55 
 
 
304 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  42.75 
 
 
292 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  40.8 
 
 
321 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  41.53 
 
 
294 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  38.14 
 
 
292 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3595  alpha/beta hydrolase fold  39.07 
 
 
311 aa  159  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  39.19 
 
 
278 aa  156  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  39.67 
 
 
292 aa  155  9e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 
317 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  40.57 
 
 
292 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  41.12 
 
 
194 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  41.33 
 
 
288 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  37.87 
 
 
288 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  40.43 
 
 
305 aa  152  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  39.4 
 
 
294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  39.47 
 
 
289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  38.41 
 
 
286 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  35.1 
 
 
287 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  34.32 
 
 
287 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  43.92 
 
 
236 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  33.94 
 
 
287 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
291 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
291 aa  122  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
291 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
291 aa  118  9e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
291 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  31.67 
 
 
321 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  31.39 
 
 
346 aa  106  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  30.96 
 
 
317 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
283 aa  99.4  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  30.45 
 
 
351 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  28.86 
 
 
302 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  29.19 
 
 
302 aa  96.3  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  31.91 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  30.25 
 
 
306 aa  94  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.19 
 
 
302 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
298 aa  93.2  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  30.5 
 
 
296 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>