More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3619 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  100 
 
 
301 aa  616  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  63.16 
 
 
309 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  59.22 
 
 
317 aa  350  2e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  57.34 
 
 
292 aa  328  7e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  54.27 
 
 
292 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  57.55 
 
 
303 aa  310  2e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  51.33 
 
 
312 aa  309  5e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  53.04 
 
 
293 aa  306  3e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  52.17 
 
 
297 aa  306  3e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  55.29 
 
 
299 aa  304  1.0000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  53.72 
 
 
291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  53.24 
 
 
316 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  53.24 
 
 
297 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  53.24 
 
 
297 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  52.22 
 
 
296 aa  300  2e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  53.24 
 
 
298 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  53.24 
 
 
298 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  52.9 
 
 
298 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  52.56 
 
 
298 aa  299  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  53.24 
 
 
316 aa  298  6e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  51.54 
 
 
323 aa  296  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  49.32 
 
 
290 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  53.52 
 
 
300 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  48.98 
 
 
290 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  53.58 
 
 
298 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  53.98 
 
 
298 aa  291  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  52.38 
 
 
291 aa  291  7e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  50.85 
 
 
291 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  50.17 
 
 
296 aa  289  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  49.5 
 
 
298 aa  289  4e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  53.63 
 
 
298 aa  288  6e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  52.17 
 
 
295 aa  288  7e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  53.38 
 
 
308 aa  286  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  53.4 
 
 
308 aa  286  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  47.95 
 
 
294 aa  286  2.9999999999999996e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  52.9 
 
 
299 aa  285  5e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  53.06 
 
 
308 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  46.76 
 
 
303 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  50.17 
 
 
294 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  52.41 
 
 
297 aa  280  3e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  52.2 
 
 
298 aa  278  9e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  51.71 
 
 
304 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  50.51 
 
 
292 aa  270  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  51.81 
 
 
290 aa  267  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  46.96 
 
 
301 aa  265  5.999999999999999e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  47.28 
 
 
301 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  45.79 
 
 
302 aa  261  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  46.46 
 
 
301 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  52.51 
 
 
294 aa  259  3e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  44.15 
 
 
304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  44.15 
 
 
304 aa  239  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  47.8 
 
 
292 aa  239  5e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  44.15 
 
 
304 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  44.56 
 
 
297 aa  238  6.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  44.88 
 
 
301 aa  230  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  45.67 
 
 
301 aa  229  4e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  42.42 
 
 
295 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  46.1 
 
 
300 aa  221  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  42.76 
 
 
287 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  54.92 
 
 
194 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  45.18 
 
 
294 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  40.13 
 
 
313 aa  211  1e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  41.02 
 
 
287 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  42.25 
 
 
294 aa  209  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  41.41 
 
 
336 aa  206  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  42.11 
 
 
278 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3595  alpha/beta hydrolase fold  44.33 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  46.13 
 
 
288 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  44.07 
 
 
292 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  40.39 
 
 
309 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  39.78 
 
 
286 aa  191  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  41.41 
 
 
305 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  39.8 
 
 
292 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  39.6 
 
 
288 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  40.26 
 
 
305 aa  188  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  38.98 
 
 
321 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 
305 aa  187  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  40.8 
 
 
292 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  41.4 
 
 
292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  51.43 
 
 
236 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  39.5 
 
 
289 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  37.97 
 
 
292 aa  160  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 
287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  36.3 
 
 
291 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 
291 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 
291 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  36.4 
 
 
291 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  35.93 
 
 
291 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  32.24 
 
 
283 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
309 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
309 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  29.35 
 
 
309 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  31.97 
 
 
282 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  34.88 
 
 
301 aa  99.8  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
306 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  30.27 
 
 
306 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0113  putative hydrolase protein  29.35 
 
 
267 aa  97.4  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal  0.0574017 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  33.18 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  31.47 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>