More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1787 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
304 aa  611  9.999999999999999e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  77.49 
 
 
292 aa  424  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  73.01 
 
 
292 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  64.93 
 
 
298 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  64.93 
 
 
298 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  64.58 
 
 
298 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  62.33 
 
 
293 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  62.93 
 
 
316 aa  364  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  66.19 
 
 
291 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  63.95 
 
 
316 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  61.99 
 
 
323 aa  362  3e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  64.93 
 
 
298 aa  362  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  66.3 
 
 
290 aa  361  9e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  63.01 
 
 
297 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  63.01 
 
 
297 aa  361  1e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  66.43 
 
 
298 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  62.89 
 
 
298 aa  358  7e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  65.47 
 
 
300 aa  357  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  66.08 
 
 
298 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  62.28 
 
 
296 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  60.82 
 
 
296 aa  354  1e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  63.35 
 
 
292 aa  353  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  59.18 
 
 
299 aa  349  3e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  62.98 
 
 
308 aa  345  4e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  58.51 
 
 
292 aa  341  9e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  60.75 
 
 
299 aa  339  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  58.78 
 
 
297 aa  333  3e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  60.44 
 
 
308 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  60.07 
 
 
308 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  54.12 
 
 
312 aa  310  1e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  55.24 
 
 
295 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  54.67 
 
 
297 aa  300  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  51.89 
 
 
294 aa  294  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  56.73 
 
 
303 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  46.39 
 
 
290 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  46.05 
 
 
290 aa  288  8e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  53.98 
 
 
291 aa  288  9e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  52.8 
 
 
291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  53.85 
 
 
298 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  45.33 
 
 
294 aa  278  1e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  51.71 
 
 
301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  52.43 
 
 
309 aa  270  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  48.25 
 
 
303 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  49.1 
 
 
304 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  49.1 
 
 
304 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  52.76 
 
 
294 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  49.1 
 
 
304 aa  264  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  51.1 
 
 
298 aa  259  4e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  43.99 
 
 
301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  44.69 
 
 
317 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  42.32 
 
 
302 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  42.12 
 
 
301 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  45.05 
 
 
297 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  40.61 
 
 
301 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  43.75 
 
 
295 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  42.61 
 
 
294 aa  207  2e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  43.15 
 
 
300 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  43.01 
 
 
278 aa  206  4e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  44.06 
 
 
292 aa  205  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  51.6 
 
 
194 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  42.56 
 
 
321 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 
301 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  45.27 
 
 
301 aa  195  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  41.02 
 
 
336 aa  195  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3595  alpha/beta hydrolase fold  41.34 
 
 
311 aa  193  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  40.91 
 
 
292 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 
294 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  41.75 
 
 
289 aa  186  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  40.77 
 
 
305 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  39.5 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  37.67 
 
 
287 aa  182  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  41.3 
 
 
292 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  38.28 
 
 
292 aa  179  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  41.25 
 
 
286 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  39.36 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  37.8 
 
 
288 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  39.93 
 
 
309 aa  171  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  43.12 
 
 
288 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  36.75 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 
291 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  37.41 
 
 
291 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  34.47 
 
 
287 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  40.47 
 
 
305 aa  158  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
291 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
291 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
291 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  40.13 
 
 
305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  48.68 
 
 
236 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 
282 aa  132  5e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  34.41 
 
 
283 aa  130  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  37.59 
 
 
290 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  31.37 
 
 
262 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  26.83 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 
303 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  34.27 
 
 
320 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
309 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  30.88 
 
 
321 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  23.61 
 
 
289 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  25.26 
 
 
291 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  23.26 
 
 
289 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>