More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0983 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 312 aa  652    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  58.11 
 
 		 299 aa  345  8e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  56.61 
 
 		 300 aa  342  5e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  57.14 
 
 		 308 aa  339  4e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  57.63 
 
 		 308 aa  330  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  53.74 
 
 		 292 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  58.63 
 
 		 308 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  52.36 
 
 		 298 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  52.36 
 
 		 298 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  52.36 
 
 		 298 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  56.27 
 
 		 299 aa  321  8e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  52.03 
 
 		 316 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  52.03 
 
 		 298 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  53.06 
 
 		 293 aa  318  7e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  51.69 
 
 		 316 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  51.35 
 
 		 296 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  53.4 
 
 		 292 aa  318  1e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  51.69 
 
 		 297 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  51.69 
 
 		 297 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  52.7 
 
 		 323 aa  316  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  52.36 
 
 		 298 aa  315  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  52.92 
 
 		 298 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  52.03 
 
 		 296 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  54.12 
 
 		 304 aa  310  1e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  52.23 
 
 		 298 aa  310  2e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  51.33 
 
 		 301 aa  309  5e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  49.32 
 
 		 297 aa  305  8.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  51.36 
 
 		 291 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  53.7 
 
 		 292 aa  297  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  55.77 
 
 		 290 aa  294  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  48.01 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  47.14 
 
 		 290 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  50.18 
 
 		 303 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  51.42 
 
 		 297 aa  286  4e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  46.69 
 
 		 294 aa  285  8e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  46.46 
 
 		 290 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  45.79 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  51.84 
 
 		 292 aa  277  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  47.1 
 
 		 294 aa  275  5e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  49.82 
 
 		 295 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  46.1 
 
 		 298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  47.64 
 
 		 291 aa  265  5.999999999999999e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  47.14 
 
 		 291 aa  261  6.999999999999999e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  45.55 
 
 		 304 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  45.55 
 
 		 304 aa  258  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  45.55 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  48 
 
 		 294 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  43.97 
 
 		 317 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  41.81 
 
 		 301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  42.76 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  41.95 
 
 		 301 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  44.24 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 		 301 aa  226  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  41.89 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  39.8 
 
 		 295 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  53.11 
 
 		 194 aa  206  4e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  39.42 
 
 		 313 aa  204  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  39.72 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  40.14 
 
 		 287 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3595  alpha/beta hydrolase fold  37.66 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  40.07 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  38.57 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 		 287 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  40 
 
 		 294 aa  199  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  39.34 
 
 		 292 aa  198  9e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  38.65 
 
 		 286 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  41.61 
 
 		 288 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  39.8 
 
 		 301 aa  197  3e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  38.13 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  38.59 
 
 		 301 aa  195  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  38.05 
 
 		 321 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 		 336 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  37.76 
 
 		 292 aa  188  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  39.32 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  38.72 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  37.3 
 
 		 292 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  52.54 
 
 		 236 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  37.07 
 
 		 289 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  37.74 
 
 		 309 aa  179  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  39.27 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  38.91 
 
 		 305 aa  170  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  35.76 
 
 		 292 aa  169  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  38.64 
 
 		 291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  38.64 
 
 		 291 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  38.26 
 
 		 291 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  37.83 
 
 		 291 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  37.83 
 
 		 291 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  35.36 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  36.96 
 
 		 290 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  32.09 
 
 		 283 aa  132  9e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  31.99 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  32.08 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  34.53 
 
 		 346 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  31.82 
 
 		 335 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  31.05 
 
 		 351 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  31.58 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  29.19 
 
 		 302 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 		 302 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 291 aa  108  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>