More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3063 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
295 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  73.61 
 
 
297 aa  446  1.0000000000000001e-124  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  77.51 
 
 
294 aa  428  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  61.64 
 
 
304 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  61.99 
 
 
304 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  61.64 
 
 
304 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  57.59 
 
 
294 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  57.64 
 
 
291 aa  331  8e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  58.93 
 
 
291 aa  329  3e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  51.05 
 
 
290 aa  325  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  51.05 
 
 
290 aa  325  6e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  55.86 
 
 
292 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  56.1 
 
 
292 aa  316  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  51.23 
 
 
294 aa  312  2.9999999999999996e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  58.91 
 
 
303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  53.06 
 
 
300 aa  302  4.0000000000000003e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  53.9 
 
 
298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  55.24 
 
 
304 aa  301  6.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  53.66 
 
 
291 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4275  putative hydrolase  53.63 
 
 
323 aa  299  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0484838 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  53.24 
 
 
297 aa  298  8e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  55.44 
 
 
293 aa  297  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  51.69 
 
 
296 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0433  alpha/beta hydrolase fold  52.94 
 
 
296 aa  295  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  59 
 
 
290 aa  294  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  52.6 
 
 
298 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  52.6 
 
 
298 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  52.6 
 
 
298 aa  291  7e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  51.55 
 
 
303 aa  291  9e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3067  alpha/beta hydrolase fold  53.79 
 
 
292 aa  290  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.165239  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  51.9 
 
 
298 aa  288  7e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3619  putative hydrolase  52.17 
 
 
301 aa  288  7e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0960552  normal  0.130689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  53.38 
 
 
299 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0537  putative hydrolase  51.56 
 
 
316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0347  putative epoxide hydrolase  51.56 
 
 
297 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0359  putative epoxide hydrolase  51.56 
 
 
297 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6314  Alpha/beta hydrolase  52.25 
 
 
298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  51.9 
 
 
316 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  52 
 
 
309 aa  282  5.000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2875  alpha/beta hydrolase fold  51.58 
 
 
298 aa  279  5e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3012  alpha/beta hydrolase fold  51.23 
 
 
298 aa  276  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0256  haloacetate dehalogenase H-1 protein  50.86 
 
 
308 aa  276  4e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.518254  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  49.82 
 
 
312 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  51.37 
 
 
298 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1631  alpha/beta hydrolase fold  54.65 
 
 
292 aa  272  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0105  alpha/beta hydrolase fold protein  50.34 
 
 
308 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0098  alpha/beta hydrolase fold  50 
 
 
308 aa  265  8e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.480841  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0129  alpha/beta hydrolase fold  51.3 
 
 
299 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.144128 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  46.31 
 
 
301 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  46.31 
 
 
301 aa  258  8e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  44.97 
 
 
302 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3226  alpha/beta hydrolase fold protein  47.75 
 
 
297 aa  249  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000476161 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  44.52 
 
 
301 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  43.84 
 
 
295 aa  229  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37530  putative hydrolase  43.54 
 
 
300 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.380275  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4478  alpha/beta hydrolase fold  42.53 
 
 
317 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  47.14 
 
 
278 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2640  putative hydrolase  62.42 
 
 
194 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.660495  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  43.79 
 
 
294 aa  222  4.9999999999999996e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3595  alpha/beta hydrolase fold  43.1 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  47.81 
 
 
301 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1021  alpha/beta hydrolase fold protein  44.89 
 
 
286 aa  212  7.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256677  normal  0.0572877 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  43.58 
 
 
292 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  47.47 
 
 
301 aa  209  5e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  46.26 
 
 
294 aa  208  8e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00788  epoxide hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08810)  40.76 
 
 
313 aa  206  5e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0593995  normal  0.200969 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  41.03 
 
 
287 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6541  alpha/beta hydrolase fold protein  40.82 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.403554  normal  0.0826923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  46.28 
 
 
288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0534  alpha/beta hydrolase fold  39.32 
 
 
336 aa  196  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0491  alpha/beta hydrolase fold  39.73 
 
 
321 aa  196  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  40.34 
 
 
292 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 
291 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  41.16 
 
 
289 aa  189  5.999999999999999e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  39.58 
 
 
291 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  41.36 
 
 
305 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5106  alpha/beta hydrolase fold protein  38.36 
 
 
287 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0636822  normal  0.0262926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  41.64 
 
 
292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  40.88 
 
 
292 aa  183  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  38.87 
 
 
291 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  38.87 
 
 
291 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  39.44 
 
 
291 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  37.37 
 
 
287 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4324  alpha/beta hydrolase fold  40.51 
 
 
309 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4177  alpha/beta hydrolase fold protein  39.74 
 
 
305 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.444474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3868  alpha/beta hydrolase fold  39.74 
 
 
305 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  40.93 
 
 
292 aa  168  9e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0115  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  47.7 
 
 
236 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129492  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  37.59 
 
 
282 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  35.86 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  35.23 
 
 
290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  33.11 
 
 
311 aa  133  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  33.33 
 
 
335 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 
262 aa  123  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  33.22 
 
 
346 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 
287 aa  119  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0113  putative hydrolase protein  31.06 
 
 
267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.813135  normal  0.0574017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  30.63 
 
 
351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  33.77 
 
 
335 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
302 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>