More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2417 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
302 aa  616  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  72.19 
 
 
302 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  70.86 
 
 
302 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  70.86 
 
 
302 aa  444  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  65.61 
 
 
306 aa  395  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  61.15 
 
 
317 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  61.06 
 
 
304 aa  369  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  59.3 
 
 
296 aa  352  2.9999999999999997e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0851  alpha/beta hydrolase fold  51.2 
 
 
320 aa  290  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  50.36 
 
 
321 aa  268  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  46.69 
 
 
312 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  39.74 
 
 
309 aa  207  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  37.04 
 
 
335 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  36.1 
 
 
346 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  44.62 
 
 
292 aa  181  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  36.59 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  38.04 
 
 
290 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  38.6 
 
 
306 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  38.6 
 
 
306 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  35.59 
 
 
311 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  36.13 
 
 
282 aa  159  8e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  36.2 
 
 
284 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  33.12 
 
 
319 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  34.8 
 
 
278 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  33.81 
 
 
297 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  34.7 
 
 
294 aa  149  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 
309 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 
309 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  32.55 
 
 
309 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  35.25 
 
 
291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  33.45 
 
 
324 aa  146  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 
291 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  34.31 
 
 
291 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  34.31 
 
 
335 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  31.23 
 
 
291 aa  145  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
291 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2627  alpha/beta hydrolase  36.78 
 
 
289 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.158878 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  33.58 
 
 
291 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  34.03 
 
 
348 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  34 
 
 
340 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  34.72 
 
 
351 aa  142  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  33.93 
 
 
287 aa  142  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.62 
 
 
341 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  32.65 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
298 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  33.59 
 
 
262 aa  139  6e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  35.76 
 
 
309 aa  136  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  31.79 
 
 
278 aa  132  6e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5733  alpha/beta hydrolase fold protein  31.45 
 
 
288 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  30.63 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
298 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  33.1 
 
 
289 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  31.44 
 
 
292 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0503  alpha/beta hydrolase fold protein  32.97 
 
 
292 aa  122  7e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0988269  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  33.77 
 
 
297 aa  120  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  32.54 
 
 
300 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  31.85 
 
 
292 aa  116  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 
291 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  30.46 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
302 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  30.56 
 
 
305 aa  112  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  33.45 
 
 
292 aa  112  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 
295 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  28.01 
 
 
284 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  29.37 
 
 
287 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  30.1 
 
 
312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  29.87 
 
 
301 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  28.62 
 
 
290 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 
289 aa  109  5e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  28.91 
 
 
290 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 
289 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4103  alpha/beta hydrolase fold  29.55 
 
 
301 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822842  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  32.88 
 
 
292 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
291 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
288 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  27.55 
 
 
294 aa  105  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  29.5 
 
 
286 aa  105  9e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3350  alpha/beta hydrolase fold  32.5 
 
 
292 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3097  alpha/beta hydrolase fold  28.19 
 
 
301 aa  104  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  25.53 
 
 
290 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
309 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  27.02 
 
 
303 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  31.54 
 
 
293 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  29.76 
 
 
294 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5248  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 
287 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1770  alpha/beta hydrolase fold  25.8 
 
 
323 aa  99  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00973065  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0158  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 
296 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  29.14 
 
 
299 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 
291 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3414  alpha/beta hydrolase fold protein  31.13 
 
 
294 aa  97.1  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6597  alpha/beta hydrolase fold protein  29.47 
 
 
301 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446556  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 
304 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  27.18 
 
 
303 aa  95.5  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5417  alpha/beta fold family hydrolase  34.29 
 
 
288 aa  95.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.779274  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
290 aa  94.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2348  alpha/beta hydrolase fold protein  42.52 
 
 
275 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 
309 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  29.8 
 
 
303 aa  94  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  30.96 
 
 
270 aa  93.6  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>