More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2970 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 315 aa  617  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  32.39 
 
 		 306 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 309 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  32.99 
 
 		 320 aa  125  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  31.42 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  36.43 
 
 		 281 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  27.89 
 
 		 291 aa  119  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  35.29 
 
 		 292 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  32.67 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  30.46 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  30.61 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  31.94 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 291 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  30.8 
 
 		 297 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  31.61 
 
 		 302 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  32.17 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  31.17 
 
 		 302 aa  108  8.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 291 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  31.12 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  28.38 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  28.23 
 
 		 370 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 		 298 aa  106  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  30.17 
 
 		 324 aa  105  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 340 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  34.87 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1001  alpha/beta hydrolase fold  33.57 
 
 		 291 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  31.75 
 
 		 291 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  26.87 
 
 		 291 aa  99  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  28.31 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  27.62 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  28.28 
 
 		 317 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  32.65 
 
 		 288 aa  95.9  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  28.31 
 
 		 290 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  30.66 
 
 		 298 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  28.67 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  28.15 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  32.99 
 
 		 288 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  32.99 
 
 		 288 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2119  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 		 291 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  29.63 
 
 		 319 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.35 
 
 		 341 aa  91.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  32.72 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  32.13 
 
 		 348 aa  90.9  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  26.56 
 
 		 304 aa  90.5  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4242  alpha/beta hydrolase fold protein  29.07 
 
 		 271 aa  90.1  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.992424  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  29.97 
 
 		 309 aa  89.4  7e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3194  alpha/beta hydrolase fold  31.68 
 
 		 309 aa  89  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0270844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  26.71 
 
 		 282 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  31.91 
 
 		 292 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  29.82 
 
 		 283 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2835  alpha/beta hydrolase fold protein  32.97 
 
 		 294 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  25.84 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3835  Alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0435059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  26.47 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  26.39 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  24.36 
 
 		 328 aa  82  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1476  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.479642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1354  alpha/beta hydrolase fold  30.92 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.420067  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  26.6 
 
 		 294 aa  81.3  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1548  alpha/beta hydrolase fold  26.1 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.133161  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2973  haloalkane dehalogenase  28.24 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.521193 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  23 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  32 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  23 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0366  haloacetate dehalogenase H-1  30 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0481  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.838629  normal  0.605944 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0373  haloacetate dehalogenase H-1  30 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.244741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  30 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  33 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0202  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 292 aa  80.5  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.928945 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  22.11 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  32.87 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0983  alpha/beta hydrolase fold  30.31 
 
 		 312 aa  80.1  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0535  alpha/beta hydrolase fold  30.23 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  29.61 
 
 		 300 aa  79.7  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  26.03 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  29.93 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  30.74 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  27.56 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  30.58 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  28.41 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0165  Alpha/beta hydrolase fold  30.6 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  25.95 
 
 		 275 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.13 
 
 		 346 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1864  Alpha/beta hydrolase  30 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.541932  hitchhiker  0.00668375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>