More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2119 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2119  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 307 aa  595  1e-169  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  59.94 
 
 		 370 aa  357  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4189  alpha/beta hydrolase fold protein  61.07 
 
 		 281 aa  305  7e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  33.67 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  33.23 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  33.23 
 
 		 341 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  28.42 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  32.89 
 
 		 340 aa  139  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  33.68 
 
 		 309 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  31.49 
 
 		 306 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  34.68 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  33.79 
 
 		 348 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  35.62 
 
 		 290 aa  134  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  32.42 
 
 		 309 aa  133  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  31.51 
 
 		 291 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  32.63 
 
 		 321 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  25.84 
 
 		 291 aa  125  7e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  31.16 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  32.64 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  29.83 
 
 		 288 aa  122  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  30.9 
 
 		 287 aa  122  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  31.94 
 
 		 282 aa  122  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  29.85 
 
 		 283 aa  122  9e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2970  alpha/beta hydrolase fold  34.73 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  32.65 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  28.04 
 
 		 311 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  31.16 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  37.3 
 
 		 292 aa  112  9e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 		 262 aa  108  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  33.81 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.91 
 
 		 346 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  28.95 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 		 351 aa  105  9e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  28.87 
 
 		 287 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 302 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  29.89 
 
 		 284 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  29.05 
 
 		 301 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  31.13 
 
 		 296 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  32.41 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 		 286 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 		 289 aa  99  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  25.89 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  30.77 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  29.1 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  30.64 
 
 		 304 aa  96.7  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  28.76 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  30.43 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  34.11 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  28.17 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 		 284 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 		 278 aa  94  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  30.38 
 
 		 288 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  30.38 
 
 		 288 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2732  alpha/beta hydrolase fold  30.53 
 
 		 292 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.43 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09470  Alpha/beta hydrolase fold protein  30.57 
 
 		 290 aa  90.1  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.688745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1787  alpha/beta hydrolase fold protein  30.95 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  28.83 
 
 		 319 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  26.96 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  32.72 
 
 		 270 aa  89.4  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  30.34 
 
 		 298 aa  89  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  29.43 
 
 		 307 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  30 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 288 aa  85.5  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  28.43 
 
 		 297 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  29.47 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1047  alpha/beta hydrolase fold  30.39 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  28.81 
 
 		 295 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  29.9 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  33.63 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  29 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  29.91 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3822  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 291 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4197  alpha/beta hydrolase fold protein  28.72 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2775  alpha/beta hydrolase  31.83 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5733  alpha/beta hydrolase fold protein  28.47 
 
 		 288 aa  80.9  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  30.26 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  29.59 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2087  alpha/beta hydrolase fold  25.99 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.416647 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1343  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  28.05 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  31.63 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  29.12 
 
 		 295 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  24.91 
 
 		 290 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6061  alpha/beta hydrolase fold  29.72 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507305  normal  0.301702 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  28.8 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  29.49 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0364  haloacetate dehalogenase H-1  26.76 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>