More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2668 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2668  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
278 aa  553  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4334  alpha/beta hydrolase fold protein  36.03 
 
 
278 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0684332 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3580  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
309 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.726937  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4419  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
309 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3948  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 
309 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.358584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1736  alpha/beta hydrolase fold  34.8 
 
 
290 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3621  alpha/beta hydrolase fold protein  35.31 
 
 
335 aa  135  8e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0448853  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1760  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
302 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176394  normal  0.0428772 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7003  alpha/beta hydrolase fold  35.64 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1492  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 
291 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6337  alpha/beta hydrolase fold  35.38 
 
 
291 aa  133  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2417  Alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 
302 aa  132  5e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0310  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
324 aa  132  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  0.178465 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4310  alpha/beta hydrolase fold protein  32.03 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.680972  normal  0.0221146 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0490  alpha/beta hydrolase fold  32.25 
 
 
283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 
291 aa  129  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3581  alpha/beta hydrolase fold  32.72 
 
 
302 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.950076 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1083  alpha/beta hydrolase fold  34.18 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0146  alpha/beta hydrolase fold  31.79 
 
 
306 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0971  alpha/beta hydrolase fold  33.09 
 
 
287 aa  125  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.419723 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3257  alpha/beta hydrolase fold protein  32.35 
 
 
302 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3091  Alpha/beta hydrolase  33.58 
 
 
294 aa  123  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.1055 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4769  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
282 aa  120  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5788  alpha/beta hydrolase fold protein  29.74 
 
 
321 aa  119  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1225  alpha/beta hydrolase fold  37.45 
 
 
292 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.475843  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2211  putative hydrolase  34.18 
 
 
320 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.498461  normal  0.459037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2748  alpha/beta hydrolase fold protein  27.62 
 
 
311 aa  116  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012747 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2767  alpha/beta hydrolase fold  33.21 
 
 
297 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4288  alpha/beta hydrolase fold protein  30.65 
 
 
262 aa  115  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.262225  normal  0.18848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2809  alpha/beta hydrolase fold protein  30.5 
 
 
302 aa  115  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5344  putative hydrolase  29.75 
 
 
317 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.824632  normal  0.198209 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2543  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239971  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0167  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1465  alpha/beta hydrolase fold  30.47 
 
 
296 aa  112  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3925  alpha/beta hydrolase fold  32.85 
 
 
298 aa  112  9e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0345488  normal  0.030729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0533  alpha/beta hydrolase fold  32.33 
 
 
284 aa  111  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26090  putative hydrolase  30.43 
 
 
319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.860193 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3105  alpha/beta hydrolase fold  24.73 
 
 
291 aa  109  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2869  alpha/beta hydrolase fold protein  25.9 
 
 
291 aa  108  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.415646  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0732  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  29.89 
 
 
346 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3967  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 
306 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4400  alpha/beta hydrolase fold  31.29 
 
 
306 aa  105  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.334375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  28.01 
 
 
291 aa  105  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4088  alpha/beta hydrolase fold protein  33.09 
 
 
309 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.90454  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1800  alpha/beta hydrolase fold  30.77 
 
 
351 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0840608  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  28.21 
 
 
303 aa  102  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3063  alpha/beta hydrolase fold protein  31.47 
 
 
295 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.841817  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6868  Alpha/beta hydrolase  30.63 
 
 
312 aa  99.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4032  alpha/beta hydrolase  30.88 
 
 
294 aa  99.8  5e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.118586  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 
323 aa  96.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  24.37 
 
 
290 aa  95.5  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49570  predicted protein  28.87 
 
 
326 aa  94.7  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.991073  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2996  alpha/beta hydrolase fold protein  32.26 
 
 
335 aa  95.1  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.761802  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3398  alpha/beta hydrolase fold protein  36.41 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619315  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  33.05 
 
 
301 aa  94.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5068  alpha/beta hydrolase fold protein  32.4 
 
 
297 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  47.37 
 
 
304 aa  93.6  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1047  alpha/beta hydrolase fold  33.49 
 
 
275 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.975256  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0881  alpha/beta hydrolase fold protein  45.69 
 
 
307 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.415782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5258  haloacetate dehalogenase  30.9 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3459  alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 
297 aa  90.9  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  46.49 
 
 
349 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8637  alpha/beta hydrolase fold protein  27.92 
 
 
370 aa  90.1  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0532982  normal  0.751963 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4437  alpha/beta hydrolase fold  45.69 
 
 
310 aa  90.1  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.684387  hitchhiker  0.00120619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2139  alpha/beta hydrolase fold protein  32.18 
 
 
292 aa  89.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.021352  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02030  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.79 
 
 
341 aa  89  8e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2985  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
298 aa  89  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4626  alpha/beta hydrolase fold protein  29.5 
 
 
348 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.804772 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  23.3 
 
 
287 aa  88.2  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2350  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2964  alpha/beta hydrolase fold  29.27 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391734  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2992  Haloacetate dehalogenase H-1  31.4 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.779666  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4044  alpha/beta hydrolase fold  43.97 
 
 
310 aa  86.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  42.74 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6167  alpha/beta hydrolase fold protein  30.88 
 
 
289 aa  86.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000738645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2166  alpha/beta hydrolase fold protein  31.06 
 
 
305 aa  86.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  28.33 
 
 
301 aa  85.9  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  42.74 
 
 
265 aa  85.9  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
308 aa  85.9  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6445  alpha/beta hydrolase fold protein  29.14 
 
 
340 aa  85.9  8e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.668195  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  44.72 
 
 
350 aa  85.5  9e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3922  Alpha/beta hydrolase fold  29.68 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505455  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  44.83 
 
 
308 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  26.9 
 
 
287 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0308  epoxide hydrolase-related protein  28.57 
 
 
316 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  31.46 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1453  alpha/beta hydrolase fold  34.17 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394876  normal  0.0369902 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1661  alpha/beta hydrolase fold  31.54 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.395016  normal  0.0474032 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4283  alpha/beta hydrolase fold  31.58 
 
 
300 aa  84  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1728  alpha/beta hydrolase fold protein  33.67 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.637652  normal  0.0268844 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  42.86 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  28.16 
 
 
324 aa  82  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  23.13 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.14 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6136  alpha/beta hydrolase fold protein  29.83 
 
 
294 aa  82  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  23.13 
 
 
289 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  27.43 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2960  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 
298 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1373  alpha/beta hydrolase fold protein  24.48 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.292438  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>