More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1144 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1144  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
323 aa  644    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273901  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1643  alpha/beta hydrolase fold protein  58.23 
 
 
317 aa  353  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.134408  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6731  alpha/beta hydrolase fold  51.29 
 
 
323 aa  289  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3112  alpha/beta hydrolase fold  49.68 
 
 
315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.137258  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2677  Alpha/beta hydrolase  48.89 
 
 
315 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2713  alpha/beta hydrolase fold  48.73 
 
 
315 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.812736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0362  alpha/beta hydrolase fold protein  50.63 
 
 
323 aa  276  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4328  alpha/beta hydrolase fold protein  45.85 
 
 
324 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13648  epoxide hydrolase ephA  45 
 
 
322 aa  260  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134654 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4104  putative epoxide hydrolase  48.34 
 
 
302 aa  255  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.526897  normal  0.0962746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1415  alpha/beta hydrolase fold  44.44 
 
 
312 aa  251  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.281875  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5373  alpha/beta hydrolase fold  43.96 
 
 
337 aa  243  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00480328 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3236  alpha/beta hydrolase fold protein  42.48 
 
 
308 aa  243  5e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00307159  normal  0.0988326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5157  alpha/beta hydrolase fold  45.96 
 
 
341 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4771  alpha/beta hydrolase fold  45.91 
 
 
315 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4857  alpha/beta hydrolase fold  45.91 
 
 
315 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18650  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.29 
 
 
350 aa  221  9.999999999999999e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303619  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4002  alpha/beta hydrolase fold  39.15 
 
 
351 aa  219  5e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228982  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3998  alpha/beta hydrolase fold  38.26 
 
 
344 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.260619  normal  0.902376 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1601  alpha/beta hydrolase fold  39.87 
 
 
328 aa  210  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.875012  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3828  alpha/beta hydrolase fold protein  42.59 
 
 
330 aa  209  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.792867  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11967  epoxide hydrolase ephB  38.1 
 
 
356 aa  206  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.36863  normal  0.493708 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2497  alpha/beta hydrolase fold  37.99 
 
 
323 aa  199  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0402748  hitchhiker  0.0077142 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2873  alpha/beta hydrolase fold  38.22 
 
 
314 aa  198  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.234426  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0326  alpha/beta hydrolase fold protein  42.99 
 
 
311 aa  188  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00559412  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3843  alpha/beta hydrolase fold  39.25 
 
 
316 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3670  alpha/beta hydrolase fold  35.33 
 
 
315 aa  172  5e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0409253  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3309  alpha/beta hydrolase fold  37.38 
 
 
321 aa  170  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.244903  hitchhiker  0.0000365568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1061  alpha/beta hydrolase fold protein  37.07 
 
 
283 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.39643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  32.48 
 
 
287 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2860  putative epoxide hydrolase  35.24 
 
 
334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.111933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5198  alpha/beta hydrolase fold protein  32.06 
 
 
290 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.45411e-23 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2592  alpha/beta hydrolase fold protein  30.67 
 
 
289 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3514  alpha/beta hydrolase fold protein  30.67 
 
 
289 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4298  alpha/beta hydrolase fold  36.08 
 
 
288 aa  159  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  33.54 
 
 
301 aa  159  5e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3841  alpha/beta hydrolase fold  35.33 
 
 
288 aa  159  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3496  alpha/beta hydrolase fold  38.41 
 
 
289 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.340747  normal  0.70145 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2878  alpha/beta hydrolase fold  33.96 
 
 
323 aa  158  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4150  alpha/beta hydrolase fold protein  35.53 
 
 
288 aa  158  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0383403  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2440  alpha/beta hydrolase fold  34.27 
 
 
287 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.329878 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4186  alpha/beta hydrolase fold protein  36.14 
 
 
297 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0619  alpha/beta hydrolase fold  34.76 
 
 
291 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1655  alpha/beta hydrolase fold  33.75 
 
 
331 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0987  alpha/beta hydrolase fold  32.71 
 
 
288 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0567924  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1819  alpha/beta hydrolase fold  33.43 
 
 
331 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.091231  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4449  alpha/beta hydrolase fold  35.74 
 
 
293 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.178174  normal  0.73876 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3546  alpha/beta hydrolase fold protein  33.13 
 
 
308 aa  153  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0524  alpha/beta hydrolase fold protein  36.36 
 
 
308 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2857  alpha/beta hydrolase fold  33.54 
 
 
286 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.668026  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0209  alpha/beta hydrolase fold protein  34.47 
 
 
301 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.994667  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0515  alpha/beta hydrolase fold  33.63 
 
 
343 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0061  alpha/beta hydrolase fold  34.81 
 
 
287 aa  147  3e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0702  alpha/beta hydrolase fold  33.03 
 
 
297 aa  146  5e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.506052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0474  alpha/beta hydrolase fold protein  33.74 
 
 
307 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4293  alpha/beta hydrolase fold  35.09 
 
 
304 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.523911  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2342  alpha/beta hydrolase fold protein  36.67 
 
 
287 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.556895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3311  alpha/beta hydrolase fold  34.65 
 
 
351 aa  143  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00000971087  hitchhiker  0.0000356017 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1766  alpha/beta hydrolase fold protein  35 
 
 
304 aa  142  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0495  alpha/beta hydrolase fold protein  35.37 
 
 
345 aa  142  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2696  alpha/beta hydrolase fold  31.45 
 
 
291 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  decreased coverage  0.00208278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0259  alpha/beta hydrolase fold protein  37.03 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.951313  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0991  Alpha/beta hydrolase fold  30.67 
 
 
300 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00272364  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5947  alpha/beta hydrolase fold  33.86 
 
 
390 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00350915 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5525  alpha/beta hydrolase fold  33.15 
 
 
367 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0322  alpha/beta hydrolase fold  46.33 
 
 
349 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.529473  normal  0.20701 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5889  alpha/beta hydrolase fold  33.15 
 
 
367 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.159226  normal  0.26176 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0448  alpha/beta hydrolase fold  32.26 
 
 
292 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122113  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6398  alpha/beta hydrolase fold  31.61 
 
 
367 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.234405 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0214  alpha/beta hydrolase fold protein  30.25 
 
 
284 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.252127  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1598  alpha/beta hydrolase fold protein  32.8 
 
 
328 aa  136  5e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00288726 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6110  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
376 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173305  normal  0.160185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3441  alpha/beta hydrolase fold  34.3 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.331156  normal  0.0655305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1035  alpha/beta hydrolase fold protein  32.6 
 
 
303 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.493601  normal  0.43821 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9230  epoxide hydrolase  32.05 
 
 
371 aa  132  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.247355  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5871  alpha/beta hydrolase fold  33.06 
 
 
376 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4844  alpha/beta hydrolase fold protein  32.6 
 
 
308 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0276  alpha/beta hydrolase fold  31.27 
 
 
434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3015  alpha/beta hydrolase fold  31.06 
 
 
287 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1459  alpha/beta fold family hydrolase  34.08 
 
 
296 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1990  alpha/beta hydrolase fold  31.25 
 
 
308 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2842  alpha/beta hydrolase fold  32.08 
 
 
434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  44.92 
 
 
313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.338915  normal  0.660761 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2679  alpha/beta hydrolase fold  31.66 
 
 
288 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.113925  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1436  alpha/beta hydrolase fold  31.21 
 
 
308 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0205853 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0419  alpha/beta hydrolase fold  33.82 
 
 
270 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1212  alpha/beta hydrolase fold  32.92 
 
 
293 aa  127  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.294809 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1024  alpha/beta hydrolase fold  32.22 
 
 
300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1292  alpha/beta fold family hydrolase  32.89 
 
 
311 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2541  alpha/beta fold family hydrolase  32.89 
 
 
311 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.072753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8858  alpha/beta hydrolase fold protein  30.43 
 
 
299 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0269  alpha/beta fold family hydrolase  32.89 
 
 
296 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.127218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0541  alpha/beta fold family hydrolase  32.89 
 
 
296 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1365  alpha/beta fold family hydrolase  32.89 
 
 
296 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1026  alpha/beta fold family hydrolase  32.89 
 
 
296 aa  125  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29750  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  40.12 
 
 
293 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1477  alpha/beta hydrolase fold protein  30.91 
 
 
308 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0994252  normal  0.0692812 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1287  alpha/beta fold family hydrolase  32.89 
 
 
349 aa  125  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1770  hydrolase protein  31.1 
 
 
311 aa  124  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  0.200622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3820  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
276 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.787957  normal  0.0192298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>